Počet záznamů: 1  

p53 Binds Preferentially to Non-B DNA Structures Formed by the Pyrimidine-Rich Strands of GAA center dot TTC Trinucleotide Repeats Associated with Friedreich's Ataxia

  1. 1.
    SYSNO ASEP0520186
    Druh ASEPJ - Článek v odborném periodiku
    Zařazení RIVJ - Článek v odborném periodiku
    Poddruh JČlánek ve WOS
    Názevp53 Binds Preferentially to Non-B DNA Structures Formed by the Pyrimidine-Rich Strands of GAA center dot TTC Trinucleotide Repeats Associated with Friedreich's Ataxia
    Tvůrce(i) Helma, Robert (BFU-R) ORCID
    Bažantová, Pavla (BFU-R)
    Petr, Marek (BFU-R) ORCID
    Adámik, Matěj (BFU-R) ORCID
    Renčiuk, Daniel (BFU-R) RID, ORCID
    Tichý, Vlastimil (BFU-R) RID
    Pastuchová, Alena (BFU-R) ORCID
    Soldanová, Zuzana (BFU-R) ORCID
    Pečinka, Petr (BFU-R) RID
    Bowater, R. P. (GB)
    Fojta, Miroslav (BFU-R) RID, ORCID
    Brázdová, Marie (BFU-R) RID, ORCID
    Celkový počet autorů12
    Číslo článku2078
    Zdroj.dok.Molecules. - : MDPI
    Roč. 24, č. 11 (2019)
    Poč.str.14 s.
    Forma vydáníOnline - E
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Země vyd.CH - Švýcarsko
    Klíč. slovadynamic mutations ; disease ; length
    Vědní obor RIVCE - Biochemie
    Obor OECDBiochemistry and molecular biology
    CEPGA19-15168S GA ČR - Grantová agentura ČR
    GA16-01625S GA ČR - Grantová agentura ČR
    GJ17-19170Y GA ČR - Grantová agentura ČR
    EF15_003/0000477 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
    Způsob publikováníOpen access
    Institucionální podporaBFU-R - RVO:68081707
    UT WOS000472631000051
    DOI10.3390/molecules24112078
    AnotaceExpansions of trinucleotide repeats (TNRs) are associated with genetic disorders such as Friedreich's ataxia. The tumor suppressor p53 is a central regulator of cell fate in response to different types of insults. Sequence and structure-selective modes of DNA recognition are among the main attributes of p53 protein. The focus of this work was analysis of the p53 structure-selective recognition of TNRs associated with human neurodegenerative diseases. Here, we studied binding of full length p53 and several deletion variants to TNRs folded into DNA hairpins or loops. We demonstrate that p53 binds to all studied non-B DNA structures, with a preference for non-B DNA structures formed by pyrimidine (Py) rich strands. Using deletion mutants, we determined the C-terminal DNA binding domain of p53 to be crucial for recognition of such non-B DNA structures. We also observed that p53 in vitro prefers binding to the Py-rich strand over the purine (Pu) rich strand in non-B DNA substrates formed by sequence derived from the first intron of the frataxin gene. The binding of p53 to this region was confirmed using chromatin immunoprecipitation in human Friedreich's ataxia fibroblast and adenocarcinoma cells. Altogether these observations provide further evidence that p53 binds to TNRs' non-B DNA structures.
    PracovištěBiofyzikální ústav
    KontaktJana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244
    Rok sběru2020
    Elektronická adresahttps://www.mdpi.com/1420-3049/24/11/2078/pdf
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.