Počet záznamů: 1  

The DNA binding of insect Fork head factors is strongly influenced by the negative cooperation of neighbouring bases

    1.
    SYSNO ASEP0136064
    Druh ASEPJ - Článek v odborném periodiku
    Zařazení RIVJ - Článek v odborném periodiku
    Poddruh JOstatní články
    NázevThe DNA binding of insect Fork head factors is strongly influenced by the negative cooperation of neighbouring bases
    Tvůrce(i) Takiya, S. (JP)
    Gaži, Michal (ENTU-I)
    Mach, Václav (ENTU-I)
    Zdroj.dok.Insect Biochemistry and Molecular Biology. - : Elsevier - ISSN 0965-1748
    Roč. 33, - (2003), s. 1145-1154
    Poč.str.10 s.
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Země vyd.GB - Velká Británie
    Klíč. slovaDrosophila ; bombys ; Galleria
    Vědní obor RIVEB - Genetika a molekulární biologie
    CEPKSK5052113 GA AV ČR - Akademie věd
    GA301/96/0153 GA ČR - Grantová agentura ČR
    ME 176 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
    CEZAV0Z5007907 - ENTU-I, BC-A
    AnotaceThe Drosophila melanogaster Fork head and Bombyx mori SGF1/Fork head proteins are key regulators of tissue specific gene expression in the modified larval labial glands. Here we use the competitive electrophoretic mobility shift assay to create a detailed Fork head binding matrix and we investigate some unusual features of the Fork head interaction with DNA. We found that the Fork head-DNA interaction is context dependent-the binding specificity of the protein is partly determined by specific combinations of neighbouring bases. Although the total number of the sub-optimal dinucleotide steps is not high, the negative cooperation of neighbouring bases significantly contributes to the overall binding site specificity. Our results allow efficient recognition of insect Fork head binding sites and we show that the putative Fork head cognate elements preferentially accumulate in the near upstream region of genes abundantly expressed in the labial gland. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.
    PracovištěEntomologický ústav (do r. 2005)
    KontaktHelena Musilová, musilova@entu.cas.cz, Tel.: 387 775 216
    Rok sběru2004

Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.

Přijmout všeNastaveníOdmítnout vše