Diagnostická souprava RT-qPCR ICHTident na detekci a kvantifikaci Ichthyophthirius multifiliis ve vzorcích vody, tkání a kožních stěrů

0584477 - ÚBO 2024 RIV CZ cze L - Prototyp, funkční vzorek
Šindelka, Radek - Mendel, Jan
Diagnostická souprava RT-qPCR ICHTident na detekci a kvantifikaci Ichthyophthirius multifiliis ve vzorcích vody, tkání a kožních stěrů.
[Diagnostic set RT-qPCR ICHTident for detection and quantification of Ichthyopthirius multifiliis in water, tissue and skin samples.]
Interní kód: 18/2023 ; 2023
Technické parametry: Zařazeno do portfolia služeb Centra aplikované zoologie ÚBO a již nabízeno veřejnosti.
Ekonomické parametry: Současná úroveň produkce lososovitých ryb pokrývá přibližně 50 % celkové spotřeby v ČR. V dalším období se předpokládá nárůst až o 500 tun ročně. Nová diagnostická souprava by se mohla podílet až na 10 % tohoto nárůstu. Včasné nastavení léčebných a preventivních opatření v případě ohrožení i celková optimalizace podmínek chovu lososovitých ryb v RAS (zvýšení přežití, snížení nákladů na chov atd.) by měla pozitivně ovlivnit výši ztrát v průběhu produkčního cyklu na úrovni minimálně 10–20 %. Zvýšení produkce prostřednictvím snížení ztrát, způsobených různými původci a pohybujících se v průběhu celého produkčního cyklu na úrovni 30–50 %, třeba i o 1 %, přinese při realizační ceně 100 Kč za 1 kg tržních ryb vyšší tržby o 50–60 tis. Kč.
Grant CEP: GA MZe(CZ) QK21010030
Institucionální podpora: RVO:68081766 ; RVO:86652036
Klíčová slova: quantitative PCR * detection * Ichthyopthirius
Obor OECD: Fishery; Fishery (BTO-N)

Cílem vývoje funkčního vzorku diagnostické soupravy RT-qPCR ICHTident bylo přinést do rybochovných zařízení spolehlivý a cenově dostupný nástroj pro monitoring chovného prostředí a včasnou detekci míry ohrožení nežádoucími parazity. Vyvinout a validovat detekční systém založený na reverzně-transkripční PCR v reálném čase (RT-qPCR), který by umožňoval spolehlivou identifikaci a kvantifikaci Ichthyophthirius multifiliis původce ichtyoftiriózy (white spot disease, ICH) ve vzorcích vody, tkání a kožních stěrů v intenzivních chovech ryb.

The goal of development of diagnostic set RT-qPCR ICHTident was to establish reliable and cheap tool for fish producers to monitor fish environment and early detection of pathogens. Developed and validated detection system is based on reverse transcription PCR in a real time and it allowed reliable identification and quanitification of Ichthyopthirius multifiliis causing white spot disease (Ich) in water, tissue and skin scratch samples in fish farms.
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352410