Počet záznamů: 1
Thiophene-linked tetramethylbodipy-labeled nucleotide for viscosity-sensitive oligonucleotide probes of hybridization and protein-DNA interactions
- 1.
SYSNO ASEP 0522408 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Thiophene-linked tetramethylbodipy-labeled nucleotide for viscosity-sensitive oligonucleotide probes of hybridization and protein-DNA interactions Tvůrce(i) Güixens-Gallardo, Pedro (UOCHB-X) RID, ORCID
Humpolíčková, Jana (UOCHB-X) ORCID
Miclea, Sebastian Paul (UOCHB-X) ORCID
Pohl, Radek (UOCHB-X) RID, ORCID
Kraus, Tomáš (UOCHB-X) RID, ORCID
Jurkiewicz, Piotr (UFCH-W) RID, ORCID
Hof, Martin (UFCH-W) RID, ORCID
Hocek, Michal (UOCHB-X) RID, ORCIDZdroj.dok. Organic & Biomolecular Chemistry. - : Royal Society of Chemistry - ISSN 1477-0520
Roč. 18, č. 5 (2020), s. 912-919Poč.str. 8 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. GB - Velká Británie Klíč. slova polymerase synthesis ; molecular rotors ; fluorescent probes Vědní obor RIV CC - Organická chemie Obor OECD Organic chemistry Vědní obor RIV – spolupráce Ústav fyzikální chemie J.Heyrovského - Fyzikální chemie a teoretická chemie CEP GA17-14791S GA ČR - Grantová agentura ČR EF16_019/0000729 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GX19-26854X GA ČR - Grantová agentura ČR Způsob publikování Omezený přístup Institucionální podpora UOCHB-X - RVO:61388963 ; UFCH-W - RVO:61388955 UT WOS 000512061200013 EID SCOPUS 85079020660 DOI 10.1039/c9ob02634g Anotace Cytosine 2′-deoxyribonucleoside dCTBdp and its triphosphate (dCTBdpTP) bearing tetramethylated thiophene-bodipy fluorophore attached at position 5 were designed and synthesized. The green fluorescent nucleoside dCTBdp showed a perfect dependence of fluorescence lifetime on the viscosity. The modified triphosphate dCTBdpTP was substrate to several DNA polymerases and was used for in vitro enzymatic synthesis of labeled oligonucleotides (ONs) or DNA by primer extension. The labeled single-stranded ONs showed a significant decrease in mean fluorescence lifetime when hybridized to the complementary strand of DNA or RNA and were also sensitive to mismatches. The labeled dsDNA sensed protein binding (p53), which resulted in the increase of its fluorescence lifetime. The triphosphate dCTBdpTP was transported to live cells where its interactions could be detected by FLIM but it did not show incorporation to genomic DNA in cellulo. Pracoviště Ústav organické chemie a biochemie Kontakt asep@uochb.cas.cz ; Kateřina Šperková, Tel.: 232 002 584 ; Jana Procházková, Tel.: 220 183 418 Rok sběru 2021 Elektronická adresa https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2020/OB/C9OB02634G#!divAbstract
Počet záznamů: 1