Počet záznamů: 1
Mitochondrial Genome of Prasinophyte Alga Pyramimonas parkeae
- 1.
SYSNO ASEP 0486306 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Mitochondrial Genome of Prasinophyte Alga Pyramimonas parkeae Tvůrce(i) Hrdá, Š. (CZ)
Hroudová, Miluše (UMG-J) RID
Vlček, Čestmír (UMG-J) RID
Hampl, V. (CZ)Celkový počet autorů 4 Zdroj.dok. Journal of Eukaryotic Microbiology. - : Wiley - ISSN 1066-5234
Roč. 64, č. 3 (2017), s. 360-369Poč.str. 10 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova cox 1 ; intron ; inverted repeats ; phylogeny ; trans-splicing Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie Obor OECD Microbiology CEP GAP506/11/1320 GA ČR - Grantová agentura ČR LQ1604 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ED1.1.00/02.0109 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Institucionální podpora UMG-J - RVO:68378050 UT WOS 000400641600007 DOI 10.1111/jeu.12371 Anotace Prasinophytes are a paraphyletic assemblage of nine heterogeneous lineages in the Chlorophyta clade of Archaeplastida. Until now, seven complete mitochondrial genomes have been sequenced from four prasinophyte lineages. Here, we report the mitochondrial genome of Pyramimonas parkeae, the first representative of the prasinophyte clade I. The circular-mapping molecule is 43,294bp long, AT rich (68.8%), very compact and it comprises two 6,671bp long inverted repeat regions. The gene content is slightly smaller than the gene-richest prasinophyte mitochondrial genomes. The single identified intron is located in the cytochrome c oxidase subunit 1 gene (cox1). Interestingly, two exons of cox1 are encoded on the same strand of DNA in the reverse order and the mature mRNA is formed by trans-splicing. The phylogenetic analysis using the data set of 6,037 positions assembled from 34 mtDNA-encoded proteins of 48 green algae and plants is not in compliance with the branching order of prasinophyte clades revealed on the basis of 18S rRNA genes and cpDNA-encoded proteins. However, the phylogenetic analyses based on all three genomic elements support the sister position of prasinophyte clades Pyramimonadales and Mamiellales. Pracoviště Ústav molekulární genetiky Kontakt Nikol Škňouřilová, nikol.sknourilova@img.cas.cz, Tel.: 241 063 217 Rok sběru 2018
Počet záznamů: 1