Počet záznamů: 1
TwoPhotonProcessor - programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo
- 1.
SYSNO ASEP 0373516 Druh ASEP L4 - Software Zařazení RIV R - Software Název TwoPhotonProcessor - programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo Překlad názvu TwoPhotonProcessor - software package for processing of in vivo calcium imaging data Tvůrce(i) Tomek, J. (CZ)
Novák, Ondřej (UEM-P)
Syka, Josef (UEM-P) RIDRok vydání 2011 Int.kód TPP-1 Lokalizace výsledku Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i. Technické parametry Programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo. Software je psaný jako provázané funkce v prostředí MATLAB. Pro běh programového balíku je nutné jádro MATLAB a Image Processing Toolbox (The MathWorks, Inc.) Ekonomické parametry Vytvořený programový balík umožňuje plně automatické zpracování dat vápníkových signálů z neuronových sítí a originálním způsobem koriguje pohybové artefakty. V některých částech tohoto procesu je algoritmizace nezbytná, v jiných částech šetří mnoho hodin lidské práce při získávání receptivních polí jednotlivých neuronů. Název vlastníka Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i. IČ vlastníka 68378041 Využ. jiným subjektem N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence Jazyk dok. cze - čeština Země vlastníka CZ - Česká republika Klíč. slova two-photon ; processing ; software Vědní obor RIV FH - Neurologie, neurochirurgie, neurovědy CEP GA309/07/1336 GA ČR - Grantová agentura ČR CEZ AV0Z50390512 - UEM-P (2005-2011) AV0Z50390703 - UEM-P (2007-2013) Anotace Softwarový balík může sloužit jako nástroj pro zpracování dat z in vivo calcium imagingu. Z naměřených dat lze v programu dále vytvořit např. receptivní pole a post-stimulační histogramy pro jednotlivé neurony. Softwarový balík byl optimalizován pro použití pro měření ve sluchové kůře drobných hlodavců, může být ale využit i pro měření v jiných částech CNS. Překlad anotace The software package can serve as a processing tool for data from in vivo calcium imaging. Neuronal receptive fields, post-stimulation histograms and astrocyte calcium data can be taken as an output. The software was optimized for usage in auditory cortex, but it is possible to use it in other parts of the CNS as well. Pracoviště Ústav experimentální medicíny Kontakt Lenka Koželská, lenka.kozelska@iem.cas.cz, Tel.: 241 062 218, 296 442 218 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1