Počet záznamů: 1
Sequencing and assembly of low copy and genic regions of isolated Triticum aestivum chromosome arm 7DS
- 1.
SYSNO ASEP 0365378 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Sequencing and assembly of low copy and genic regions of isolated Triticum aestivum chromosome arm 7DS Tvůrce(i) Berkman, O. J. (AT)
Skarshewski, A. (AU)
Lorenc, M. T. (AU)
Kubaláková, Marie (UEB-Q) RID
Šimková, Hana (UEB-Q) RID, ORCID
Batley, J. (AU)
Doležel, Jaroslav (UEB-Q) RID, ORCID
Edwards, D. (AU)Celkový počet autorů 17 Zdroj.dok. Plant Biotechnology Journal. - : Wiley - ISSN 1467-7644
Roč. 9, č. 7 (2011), s. 768-775Poč.str. 8 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova wheat genome sequence ; chromosome 7 ; genome assembly Vědní obor RIV EB - Genetika a molekulární biologie CEP GA521/07/1573 GA ČR - Grantová agentura ČR ED0007/01/01 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy CEZ AV0Z50380511 - UEB-Q (2005-2011) UT WOS 000293659700006 DOI 10.1111/j.1467-7652.2010.00587.x Anotace The genome of bread wheat (Triticum aestivum) is predicted to be greater than 16 Gbp in size and consist predominantly of repetitive elements, making the sequencing and assembly of this genome a major challenge. We have reduced genome sequence complexity by isolating chromosome arm 7DS and applied second-generation technology and appropriate algorithmic analysis to sequence and assemble low copy and genic regions of this chromosome arm. The assembly represents approximately 40% of the chromosome arm and all known 7DS genes. Comparison of the 7DS assembly with the sequenced genomes of rice (Oryza sativa) and Brachypodium distachyon identified large regions of conservation. The syntenic relationship between wheat, B. distachyon and O. sativa, along with available genetic mapping data, has been used to produce an annotated draft 7DS syntenic build, which is publicly available at http://www.wheatgenome.info. Pracoviště Ústav experimentální botaniky Kontakt David Klier, knihovna@ueb.cas.cz, Tel.: 220 390 469 Rok sběru 2012
Počet záznamů: 1