Vliv odběru vzorků a způsob jejich fixace na měření velikosti genomu

0523543 - ÚBO 2020 RIV CZ cze L3 - Certifikované metodiky
Halačka, Karel - Vetešník, Lukáš - Fedorčák, J. - Koščo, J.
Vliv odběru vzorků a způsob jejich fixace na měření velikosti genomu.
[Influence of sampling and fixation on measuring of genome size.]
Interní kód: 11/2019 ; 2019
Technické parametry: Metodika byla vydána v tištěné podobě a má přiděleno ISBN 978-80-87189-28-3.

Grant CEP: GA TA ČR TG03010048
Klíčová slova: genome size * flow cytometry * fixation
Obor OECD: Fishery

Hodnota velikosti genomu je důležitý aspekt v mnoha moderních studiích ryb. Vzhledem k relativně snadnému získání a zpracování je pro tyto účely často používána krev. Ta se však u ryb snadno sráží, a proto se obvykle používá heparin jako antikoagulant. Ukazuje se však, že přidání heparinu má za následek i zvýšení měřených hodnot při měření pomocí průtokového cytometru. Zjištěné rozdíly byly vysoce významné a lze proto doporučit vyloučení heparinu nebo korekci získaných hodnot.

Assessment of genome size is an important aspect of many modern studies on fish. Blood is the most common DNA source in fish studies due to its relative ease of sampling and processing. Fish blood, however, precipitates rapidly, leading to clotting. Consequently, anticoagulants (primarily heparin) are added at the time of sampling. Using of increasing heparin concentrations resulted in notable increases in fish erythrocyte genome size readings compared to a non-heparinised control. The differences observed were highly significant, suggesting that the results of previous comparative studies or those determining individual polyploidy may need reinterpretation.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307892