GenEx: nízkonákladový systém pro hodnocení chromozomových aneuploidií v nízkofrekvenčních mozaikách

0438888 - ÚTIA 2015 CZ cze A - Abstrakt
Schier, Jan - Kovář, Bohumil - Kuneš, Michal - Kočárek, E. - Tesner, P. - Zemčík, P. - Dubská, M. - Honec, P. - Číp, P.
GenEx: nízkonákladový systém pro hodnocení chromozomových aneuploidií v nízkofrekvenčních mozaikách.
[GenEx low cost system for evaluation of chromosome aneuploidies in low frequency mosaic form.]
Genetická konference GSGM 2014. Praha: -, 2014. s. 83-83.
[Genetická konference GSGM 2014. 24.09.2014-26.09.2014, Praha]
Grant CEP: GA TA ČR TA01010931
Institucionální podpora: RVO:67985556
Klíčová slova: image processing * microscopy * cytology * chromosome aneuploidies
Kód oboru RIV: JC - Počítačový hardware a software
http://library.utia.cas.cz/separaty/2014/ZOI/schier-0438888.pdf

Práce představuje funkční vzorek nízkonákladového mikroskopického systému pro cytologická vyšetření, konkrétně pro automatizované hodnocení chromozomových aneuploidií v nízkofrekvenčních mozaikách. Systém se skládá z fluorescenčního mikroskopu s motorizovaným posunem a laserovou osvětlovací jednotkou, propojeného se softwarovým systémem, který obsahuje databázi snímků a metadat a moduly zpracování obrazu a zobrazení výsledků a statistik. Funkční vzorek zařízení zajišťuje příslušné funkce pro automatizované pořízení snímků preparátu, jejich zpracování a vyhledávání buněčných jader a fluorescenčních signálů, jejich vyhodnocení, a pro ukládání snímků a dat do databáze a vyhledávání v této databázi.

A prototype of a low-cost miscroscope system to support cytology examinations, namely for automated evaluation of chromosome aneuploidies in mosaic form, has been introduced in the poster. It consists of a fluorescence microscope with motorized stage and laser illumination unit, attached to a software system which provides the image and metadata database as well as image processing and vizualization modules. The prototype provides the corresponding functionality to handle automated image acquisition and processing, particle analysis to find cell nuclei and hybridization signals and the functionality for database access.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0243117