Analýza sekundárních metabolitů streptomycet Ramanovou spektroskopií in vivo

0584387 - ÚPT 2024 RIV CZ cze C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Mikulová, Adéla - Petříčková, K. - Bobek, J. - Chroňáková, Alica - Samek, Ota - Pilát, Zdeněk
Analýza sekundárních metabolitů streptomycet Ramanovou spektroskopií in vivo.
[Analysis of secondary metabolites from Streptomyces by Raman spectroscopy in vivo.]
LA63. Sborník příspěvků multioborové konference LASER63. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2023 - (Mikel, B.), s. 57-60. ISBN 978-80-87441-32-9.
[LASER63. Třešť (CZ), 18.10.2023-20.10.2023]
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341; GA MZd(CZ) NV17-30091A
Grant ostatní: AV ČR(CZ) StrategieAV21/26; AV ČR(CZ) StrategieAV21/21
Program: StrategieAV; StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Raman spectroscopy * microbiology * Streptomyces * antibiotics
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics); Biochemical research methods (BC-A)

Práce se zabývá studiem Ramanových spekter sekundárních metabolitů bakterií rodu Streptomyces, zejména polyenních antifungálních látek. Purifikované izoláty a komerční standardy těchto sloučenin byly využity k pořízení referenčních spekter, ze kterých byly odvozeny spektrální markery charakterizující konkrétní detaily chemické struktury. Verifikace pozorovaných markerů byla provedena pomocí predikcí Ramanových spekter in silico. Následně byly tyto poznatky využity ke spektroskopické charakterizaci složení sekundárních metabolitů in vivo, přímo v bakteriích rostoucích na pevném médiu. Vypracované metodiky pomohou optimalizovat podmínky pro biotechnologickou produkci antibiotik.

The work deals with the study of Raman spectra of secondary metabolites of bacteria of the genus Streptomyces, especially polyene antifungal agents. Purified isolates and commercial standards of these compounds were used to obtain reference spectra from which spectral markers characterizing specific details of the chemical structure were derived. Verification of the observed markers was performed using in silico Raman spectra predictions. Subsequently, these findings were used for the spectroscopic characterization of the composition of secondary metabolites in vivo, directly in bacteria growing on a solid medium. The developed methodologies will help to optimize the conditions for the biotechnological production of antibiotics.
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352301