MetMapper ®

0569867 - BC 2023 RIV CZ cze L - Prototyp, funkční vzorek
Zatloukalová, J. - Moos, Martin - Řimnáčová, Lucie - Šimek, Petr - Vojtíšek, J. - Verner, M. - Pánek, K. - Schůrek, J.
MetMapper ®.
[MetMapper ®.]
Interní kód: TJ04000555 ; 2022
Technické parametry: Funkční vzorek MetMapper® spočívá v nově vyvinuté a optimalizované metodě měření obsáhlých souborů diagnosticky významných organických látek v biologických vzorcích. Nové řešení představuje ucelený soubor kroků od odběru vzorku, jeho zpracování, měření technikou LC-HRMS a sofistikovanou detekcí opírající se o metody umělé inteligence, databázi více jak 2000 látek včetně léčiv a jiných cizorodých látek. Umožnuje systémové zkoumání metabolického obrazu živých organismů od bakterií, prvoků, sinic, hmyzích modelů, myší, pěvců, vybraných některých živočišných tkání i buněčných kultur až po klinické vzorky. Další unikátní vlastností je, že nástroj využívá jednotný postup přípravy a zpracování vzorků, jednu analytickou metodu a sofistikovanou strategii zpracování a vytěžování dat, což zásadně zrychluje přístup k požadovaným informacím o vzorku. Nástroj MetMapper® tak představuje novou, ucelenou strategii měření s širokým uplatněním v biomedicinální diagnostice a obecně ve výzkumu metabolismu živých organismů. Komercializací vytvořeného řešení se zabývá společnost Aiolite s.r.o., Praha.
Ekonomické parametry: MetMapper® je součástí platformy MAIA a umožní konstrukci metabolického obrazu lidského organismu, včetně sledování použité medikace a případnému výskytu dalších, organismu cizorodých látek. Přispěje k získání hlubšího poznání zdravotního stavu organismu a novému způsobu použití v klinické diagnostice s využitím AI. Pro dodavatele řešení znamená zavedení nových produktů do výroby, zvýšení objemu tržeb a zvýšení zisků. Pro uživatele řešení představuje úsporu času, snížení objemu medikamentů a včasné cílení léčby, čímž se sekundárně sníží náklady pojišťoven díky kratší době hospitalizace pacientů.
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TJ04000555
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: metabolomic analysis * plasma * serum
Obor OECD: Biochemical research methods

Nástroj MetMapper® představuje ucelené řešení spojené se sofistikovanou přípravou a zpracováním biologických vzorků, jejich měřením technikou LC-HRMS a automatickým zpracováním a vytěžováním dat pomocí 3D algoritmu pro detekci vrcholů a konvoluční neuronové sítě pro jejich hodnocení. Má za cíl jednak odstranit nedostatky konvenčního zpracování (zejména z hlediska necílených analýz), a zároveň pomocí metod umělé inteligence minimalizovat potřebu manuálního dohodnocování nálezů lidskými experty. Nástroj MetMapper® umožnuje validovaným způsobem provádět prakticky stejným postupem zkoumání metabolického obrazu ve vzorcích většiny živých organismů. Nástroj využívá jednotný postup přípravy a zpracování vzorků, jednu analytickou metodu, sofistikovanou strategii zpracování a vytěžování dat. To umožnuje současně sledovat jak centrální uhlíkový metabolismus, tak rozsáhlé soubory lipidů, medikaci pacientů, či přítomnost jiných cizorodých látek v organismu.

The MetMapper® tool represents a complete solution associated with sophisticated preparation and processing of biological samples, their measurement by LC-HRMS technique and automatic data processing and extraction using a 3D algorithm for peak detection and a convolutional neural network for their evaluation. It aims both to eliminate the shortcomings of conventional processing (especially in terms of untargeted analyses), and at the same time to minimize the need for manual reconciliation of findings by human experts using artificial intelligence methods. The MetMapper® tool enables the examination of the metabolic picture in the samples of most living organisms in a validated manner using practically the same procedure. The tool uses a uniform sample preparation and processing procedure, one analytical method, and a sophisticated data processing and extraction strategy. This makes it possible to simultaneously monitor both central carbon metabolism and extensive lipid collections, patient medication, or the presence of other foreign substances in the body.
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0341480