Software ALMA Corrimag

0555308 - ÚACH 2022 RIV CZ eng L4 - Software
Pech, M. - Bezdička, Petr
Software ALMA Corrimag.
Interní kód: 15/2021 ; 2021
Technické parametry: Programovací jazyk: Python 3.8. Knihovny: numpy, matplotlib, scipy, scikit-image, imageio, pandas. Podporované operační systémy: Windows, macOS, Linux. Nároky na hardware: min. 2 GB RAM paměti. Uživatelská rozhraní: příkazový řádek, uživatelské programy v jazyce Python.
Ekonomické parametry: Vyhodnocení prvkových map naměřených MA-XRF spektroskopií vyžaduje zkušenosti a je časově náročné. Automatické zpracování dat programem ALMA Corrimag usnadňuje vyhodnocení naměřených výsledků. Software využívá bezplatné open source knihovny programovacího jazyka Python, nabízen je k bezplatnému použití na základě licence GNU GPL 3.0. Výhodou využití jazyka Python je snadná možnost instalace, podpora většiny běžných operačních systémů (Windows, Linux, macOS), možnost instalace na neomezený počet počítačů, nízké systémové nároky.
Grant CEP: GA MK(CZ) DG18P02OVV034
Klíčová slova: correlation coeficient * element map * elemental distribution * MA-XRF * SEM-EDS * software
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
https://github.com/almaavu/Corrimag

The ALMA Corrimag program is designed for image analysis of elemental maps obtained by MA-XRF spectroscopy or SEM-EDS microscopy. It compares pairs of elemental maps and looks for their degree of correlation - the common occurrence of elements, e.g. contained in the same pigment or substrate material. The results are stored in an XLSX spreadsheet file that lists the Pearson correlation coefficient, coefficient of determination, and regression coefficients for each pair of maps. Another output is a correlation matrix showing the 2D histograms of the pairs of feature maps and the overlays of the maps in the RGB image.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329898