Metodika analýzy alternativního sestřihu

0523040 - ÚEM 2020 RIV CZ cze L3 - Certifikované metodiky
Rössner ml., Pavel - Rössnerová, Andrea
Metodika analýzy alternativního sestřihu.
[The methodology for alternative splicing detection.]
Interní kód: Alternativní sestřih NGS ; 2018
Technické parametry: Výstupy jsou aplikovatelné zejména v základním výzkumu, ověřitelné jsou v rámci recenzních řízení odborných publikací.
Ekonomické parametry: Pro realizaci metodiky je kromě standardního laboratorního vybavení nutný přístup k sekvenátoru. V současné době, kdy dochází k velkému rozvoji metod NGS, není však nutné přímé vlastnictví přístroje, jelikož řada servisních center při univerzitách a výzkumných ústavech poskytuje sekvenování jako službu i pro externí subjekty. Provedení experimentů popsaných v certifikované metodice je proto finančně vázáno především na pořízení spotřebního materiálu v cenových relacích, které odpovídají analýzám pomocí kvantitativní RT-PCR a které jsou pro většinu laboratoří běžně dostupné. Zavedení metodiky není tedy spojeno s nutností podstatného navýšení finančních prostředků na provedení analýz.
Certifikační orgán: Ústav pro státní kontrolu veterinárních biopreparátů a léčiv, Brno, Česká republika. Datum certifikace: 17.09.2018
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1508
Institucionální podpora: RVO:68378041
Klíčová slova: alternative haircut * gene expression * sequencing a new generation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology

Cílem metodiky je vytvoření protokolu, který umožní současnou analýzu exprese mRNA a alternativního sestřihu s využitím metod sekvenování nové generace. V rámci jednoho experiment bude získáno větší množství dat, což zkvalitní vědecké výstupy a povede ke zkrácení doby nutné pro analýzy.

The aim of the methodology is to develop a protocol for a simultaneous detection of mRNA expression and alternative splicing using next generation sequencing. In a single experiment more data will be obtained leading to better scientific quality shorter time needed for the analysis.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307776