Funkční vzorek - Genetická souprava STR Multiplex SALVident11 ke stanovení populačních parametrů v komerčních chovech sivenů (rod Salvelinus)

0521092 - ÚBO 2020 RIV CZ cze L - Prototyp, funkční vzorek
Mendel, Jan
Funkční vzorek - Genetická souprava STR Multiplex SALVident11 ke stanovení populačních parametrů v komerčních chovech sivenů (rod Salvelinus).
[Function sample - STR Multiplex SALVident11 Kit for the determination of population parameters in commercial stocks of charrs (genus Salvelinus).]
Interní kód: 04/2019 ; 2019
Technické parametry: Funkční vzorek sestává z výsekové raznice, kartonové krabičky (350 g lamino, jednostranný lesk, barevnost 4+0), distanční vložky, polyamidového samolepícího štítku s výsekem (plotrový) rozměru 55 x 20 mm, 2ml zkumavka s barevným víčkem a samolepícími etiketami.
Ekonomické parametry: Funkční vzorek slouží k výzkumným a komerčním účelům. Je součástí komerčního DNA servisu, který laické i odborné veřejnosti poskytuje Ústav biologie obratlovců, v. v. i. Rovněž je nabízen i samostatně jako prodejní determinační souprava. Celkové výrobní náklady vychází z nákladů na vývoj, reagencie a obalový materiál a jsou cca 27.000,- Kč. Finanční vyčíslení prodejní ceny předpokládá navýšení o přiměřený zisk.
Grant CEP: GA TA ČR TG03010048
Klíčová slova: Kit * STR panel * sex control * Salvelinus
Obor OECD: Fishery

Funkční vzorek byl navržen v rámci řešení projektu Komercializace výsledků zoologického výzkumu - aplikace využitelné v praktické ochraně přírody (TAČR TG03010048) a otestován nejen na kontrolních vzorcích odebraných v rámci tohoto projektu. Z důvodu spolehlivého porovnávání akvakulturních studií, byl nastaven koordinovaný a standardizovaný proces generování genetických dat a jejich uchovávání v čase. Byl vyvinut a zvalidován zcela unikátní Salvelinus STR panel, nazvaný SALVident11. Genetická souprava poskytuje spolehlivou determinaci chovných zdrojů 4 druhů sivenů (S. fontinalis, S. namaycush, S. alpinus, S. umbla), včetně jejich hybridů i pohlaví a umožňuje jejich monitoring od fáze nákupu až po jejich odchov. Dále umožňuje generovat populačně-genetické parametry využitelné pro chovný management sivenů a pro zdokonalování jejich chovných programů. Jeho funkčnost byla ověřena na chovných zařízeních s českým a zahraničním chovným materiálem (Rybářství Litomyšl, s.r.o., BioFish, s.r.o., Pstruhařství Skalní Mlýn, s.r.o., Klatovské rybářství a.s. – Anín, Rabí, Institute für Gewässerökologie, Fischereibiologie und Seenkunde - Mondsee a Wolfgangsee, FWM Baierl Florian, Linberg).

The functional sample was developed within the project: Commercialization of results of zoological research - applications for nature conservation practice (TACR TG03010048). It was tested on control samples collected within this project. In order to ensure a reliable comparison of aquaculture studies a coordinated and standardized process of genetic data generation and their long-time storage was elaborated. A unique Salvelinus marker panel called SALVident11 was developed and validated. The genetic kit allows reliable determination of the breeding resources of four charr species (S. fontinalis, S. namaycush, S. alpinus, S. umbla) including their hybrids and sex and enables their monitoring beginning with the phase of purchase to its distribution. It also enables to generate population genetic parameters that can be used for breeding management of charrs and for improvement of their breeding programs. Its functionality was verified by testing of stocks with Czech and foreing breeding materials (Rybářství Litomyšl, s.r.o., BioFish, s.r.o., Pstruhařství Skalní Mlýn, s.r.o., Klatovské rybářství a.s. – Anín, Rabí, Institute für Gewässerökologie, Fischereibiologie und Seenkunde - Mondsee a Wolfgangsee, FWM Baierl Florian, Linberg).
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305757