Knime4HTS

0502797 - ÚMG 2019 RIV CZ cze L4 - Software
Škuta, Ctibor - Svozil, Daniel
Knime4HTS.
[Knime4HTS.]
Interní kód: Software-2 ; 2015
Technické parametry: Knime4HTS je kombinace nových uzlů (nodes) a připravených postupů (workflows), která je vytvořena za účelem zpracování HTS dat prostřednictvím analytické platformy Knime. S použitím těchto nástrojů je možné zpracovávat surová data ve sloupcové i maticové formě. KNIME4HTS poskytuje funkcionalitu pro normalizaci dat, selekci hitů, zobrazení teplotních map HTS destiček a vytváření reportů. Připravené postupy jsou také schopny vizualizace rozsáhlé chemické knihovny ve formě 2D chemického prostoru na základě fyzikálně-chemických nebo strukturních vlastností látek. https://openscreen.cz/software/knime4hts/home/
Ekonomické parametry: Použitím těchto nástrojů je možné zpracovávat surová data ve sloupcové i maticové formě. Tyto funkcionality výrazně zjednodušší uživatelům analýzu HTS dat.
Grant CEP: GA MŠMT LO1220
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Knime * HTS data * hit selection
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
https://www.knime.com/

Knime4HTS je kombinace nových uzlů (nodes) a připravených postupů (workflows), která je vytvořena za účelem zpracování HTS dat prostřednictvím analytické platformy Knime. S použitím těchto nástrojů je možné zpracovávat surová data ve sloupcové i maticové formě. KNIME4HTS poskytuje funkcionalitu pro normalizaci dat, selekci hitů, zobrazení teplotních map HTS destiček a vytváření reportů. Připravené postupy jsou také schopny vizualizace rozsáhlé chemické knihovny ve formě 2D chemického prostoru na základě fyzikálně-chemických nebo strukturních vlastností látek.

Knime4HTS is a set of new nodes and prepared workflows designed for the processing of HTS data via the Knime Analytics Platform. Using these tools, raw plate data in a matrix or column coordinate format can be analyzed. KNIME4HTS provides functionality for raw data normalization, hit selection, the visualization of plate heatmaps and generation of screening reports. Prepared workflows are also able to visualize large chemical libraries by means of chemical space according to their physico-chemical properties and structural features.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0294681