Počet záznamů: 1  

Understanding RNA flexibility using explicit solvent simulations: The ribosomal and group I intron reverse kink-turn motifs

  1. 1.
    0370399 - BFÚ 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
    Sklenovský, P. - Florová, P. - Banáš, P. - Réblová, Kamila - Lankaš, Filip - Otyepka, M. - Šponer, Jiří
    Understanding RNA flexibility using explicit solvent simulations: The ribosomal and group I intron reverse kink-turn motifs.
    Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 7, č. 9 (2011), s. 2963-2980. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GD203/09/H046; GA AV ČR(CZ) IAA400040802; GA MŠMT(CZ) LC512; GA AV ČR(CZ) KJB400040901; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA ČR(CZ) GAP208/11/1822; GA MŠMT(CZ) LC06030
    Grant ostatní: GA ČR(CZ) GPP301/11/P558
    Program: GP
    Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702; CEZ:AV0Z40550506
    Klíčová slova: reverse kink-turn * simulation * flexibility
    Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
    Impakt faktor: 5.215, rok: 2011

    We report unrestrained, explicit solvent molecular dynamics simulations of ribosomal and intron reverse kink-turns (54 simulations in total) with different variants (ff94, ff99, ff99bsc0, ff99chiOL, and ff99bsc0chiOL) of the Cornell et al. force field. The simulations characterize the directional intrinsic flexibility of reverse kink-turns pertinent to their folded functional geometries.
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0204220

     
     
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.