Genetic diversity of Misgurnus fossilis populations from the Czech Republic and Slovakia

0342007 - ÚBO 2010 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Mendel, Jan - Lusk, Stanislav - Koščo, J. - Vetešník, Lukáš - Halačka, Karel - Papoušek, Ivo
Genetic diversity of Misgurnus fossilis populations from the Czech Republic and Slovakia.
[Genetická diverzita populací Misgurnus fossilis z České republiky a Slovenska.]
Folia zoologica. Roč. 57, 1-2 (2008), s. 90-99. ISSN 0139-7893. E-ISSN 1573-1189.
[Loaches of the genus Cobitis and related genera /3./. Šibenik, 24.09.2006-29.09.2006]
Grant CEP: GA MŽP SM/6/3/05
Klíčová slova: weather loach * control region * microsatellites
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 0.522, rok: 2008
http://www.ivb.cz/folia/57/1-2/090-099_MS1290.pdf

Monitoring of the analysed populations of the endangered fish species Misgurnus fossilis was conducted using microsatellite analysis and sequencing of a part of the control region. Absolutely first microsatellite markers for weather loach were found. Six polymorphic microsatellite loci were prepared, five of which were tested. Number of alleles per a locus ranged from 3 to 5. All studied populations are differentiated one from another (FST = 0.205 - 0.367). All sampled populations contained unique alleles. Sequential analysis of the mitochondrial control region showed great haplotype similarity of the studied populations which come from one widely spread haplotype H_1, and thus suggested possible hypothesis of recent spreading from one source.

Monitorování zkoumaných populací ohroženého druhu Misgurnus fossilis bylo prováděno pomocí analýzy mikrosatelitů a sekvenování části control regionu. Byly nalezeny zcela první mikrosatelitové markery pro weather loach. Bylo připraveno 6 polymorfních mikrosatelitových lokusů, z nichž pět bylo otestováno. Počet alel na lokus se pohyboval v rozmezí 3 - 5. Všechny zkoumané populace jsou navzájem od sebe diferencované (FST = 0.205 - 0.367) a obsahovaly jedinečné alely. Sekvenční analýza mitochondriálního control regionu ukázala velkou haplotypovou podobnost zkoumaných populací, které vznikly z jednoho široce rozšířeného haplotypu H_1 a naznačila tak možnou hypotézu o nedávném rozšíření z jednoho zdroje.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0184838