Survey of repetitive sequences in Silene latifolia with respect to their distribution on sex chromosomes

0319866 - BFÚ 2009 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Čermák, Tomáš - Kubát, Zdeněk - Hobza, Roman - Koblížková, Andrea - Widmer, A. - Macas, Jiří - Vyskot, Boris - Kejnovský, Eduard
Survey of repetitive sequences in Silene latifolia with respect to their distribution on sex chromosomes.
[Repetitivní sekvence u Silene latifolia z hlediska jejich distribuce na pohlavních chromosomech.]
Chromosome Research. Roč. 16, č. 7 (2008), s. 961-976. ISSN 0967-3849. E-ISSN 1573-6849
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA521/06/0056; GA ČR(CZ) GA204/05/2097; GA ČR(CZ) GD204/05/H505
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50510513; CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: satellites * Silene latifolia * sex chromosomes
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.405, rok: 2008

We carried out global survey of all major types of transposable elements in Silene latifolia. We found that LTR retrotransposons of gypsy type are most abundant followed by copia type while non-LTR retrotransposon of LINE and SINE types similarly as DNA transposon as less frequent. Copia retrotransposons were accumulated on the Y chromosome.

Provedli jsme systematický průzkum repetitivních sekvencí u Silene latifolia. Zjistili jsme, že převládají LTR retrotransposony typu gypsy, následované typem copia, zatímco non-LTR retrotransposony typu LINE a SINE stejně jako DNA transposony byly méně časté. Retrotransposony typu copia byly akumulovány na chromosomu Y.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0168910