Sequence analysis and heterologous expression of the lincomycin biosynthetic cluster of the type strain Streptomyces lincolnensis ATCC 25466

0315795 - MBÚ 2009 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Koběrská, Markéta - Kopecký, Jan - Olšovská, Jana - Jelínková, Markéta - Ulanová, Dana - Man, Petr - Flieger, Miroslav - Janata, Jiří
Sequence analysis and heterologous expression of the lincomycin biosynthetic cluster of the type strain Streptomyces lincolnensis ATCC 25466.
[Analýza sekvence a heterologní exprese shluku pro biosyntézu linkomycinu z typového kmene Streptomyces lincolnensis ATCC 25466.]
Folia Microbiologica. Roč. 53, č. 5 (2008), s. 395-401. ISSN 0015-5632. E-ISSN 1874-9356
Grant CEP: GA ČR GA204/05/0616; GA MŠMT 1M06011
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50200510
Klíčová slova: streptomyces lincolnensis * cosmid * lincomycin
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 1.172, rok: 2008

A cosmid bearing an insert of 38217 bp covering the gene cluster and its flanking regions type strain Streptomyces lincolnensis ATCC 25466 was sequenced. Two relatively extensive sequence changes and several hundred point mutations were identified if compared with the previously published sequence of the lincomycin industrial strain Streptomyces lincolnensis 78-11. Analysis of the cluster flanking regions revealed its localization within the genome of S. lincolnensis ATCC 25466. The cluster-bearing cosmid was integrated into the chromosome of lincomycin non-producing strains Streptomyces coelicolor CH 999 and Streptomyces coelicolor M 145. The modified strains heterologously produced lincomycin, but the level dropped to approximately 1-3% of the production in S. lincolnensis ATCC 25466

Byl sekvenován kosmid nesoucí shluk genů o velikosti 38217 pb, který byl izolován z typového kmene Streptomyces lincolnensis ATCC 25466. Porovnáním s již publikovanou sekvencí linkomycinového shluku z průmyslového kmene Streptomyces lincolnensis 78-11 byly zjištěny dva významné sekvenční rozdíly a dalších několik set bodových mutací. Kosmid nesoucí genový shluk byl vložen do chromozómů kmenů Streptomyces coelicolor CH 999 a Streptomyces coelicolor M 145, které linkomycin přirozeně neprodukují. Takto upravené kmeny produkovaly linkomycin s 1-3% výtěžnosti ve srovnání s typovým kmenem S. lincolnensis ATCC 25466
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165894