Abundance, depth distribution, and composition of aerobic bacteriochlorophyll a-producing bacteria in four basins of the central Baltic Sea

0315781 - MBÚ 2009 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Salka, I. - Moulisová, Vladimíra - Koblížek, Michal - Jost, G. - Jürgens, K. - Labrenz, M.
Abundance, depth distribution, and composition of aerobic bacteriochlorophyll a-producing bacteria in four basins of the central Baltic Sea.
[Množství, hloubkový profil a druhové složení aerobních fototrofních bakterií v Baltském moři.]
Applied and Environmental Microbiology. Roč. 74, č. 14 (2008), s. 4398-4404. ISSN 0099-2240. E-ISSN 1098-5336
Grant CEP: GA ČR GA204/05/0307; GA ČR GA206/07/0241; GA AV ČR 1QS500200570
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50200510
Klíčová slova: aerobic bacteriochlorophyll * baltic sea * epifluorescence microscopy
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 3.801, rok: 2008

The abundance, vertical distribution, and diversity of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria (AAP) were studied at four basins of the Baltic Sea. AAP were enumerated by infrared epifluorescence microscopy, and their diversity was analyzed by using pufM gene clone libraries. In addition, numbers of CFU containing the pufM gene were determined, and representative strains were isolated. Both approaches indicated that AAP reached maximal abundance in the euphotic zone. Maximal AAP abundance was 2.5 x 105 cells mL-1 (11% of total prokaryotes) or 1.0 x 103 CFU mL-1 (9 to 10% of total CFU). Environmental pufM clone sequences were grouped into 11 operational taxonomic units phylogenetically related to cultivated members of the Alpha-, Beta-, and Gammaproteobacteria. In spite of varying pufM compositions, five clones were present in all libraries

Rozšíření a druhové složení aerobních fototrofních bakterií (AAP) bylo analyzováno ve čtyřech proláklinách Baltského moře. Množství AAP bakterií bylo určeno pomocí infračervené epifluorescenční mikroskopie, jejich druhové složení potom pomocí klonovacích knihoven genu pufM. AAP bakterie se vyskytovaly v eufotické zóně na všech studovaných stanicích, jejich počty dosahovaly maximálně 2.5 x 105 buněk mL-1 (11% všech prokaryot). Environmentální sekvence byly rozčleněny do 11 pracovních taxonomických skupin, které byly příbuzné kultivovaným zástupcům Alfa-, Beta-, and Gamaproteobakterií. Přes značnou proměnlivost, pět základních forem pufM genu bylo přítomno ve všech knihovnách. 25-30% všech klonů tvořily sekvence příbuzné pufM genu Jannaschia sp.. Pravděpodobně betaproteobakteriální geny byly zaznamenány na třech stanicích, klony přibuzné Loktanelle vestfoldensis představovaly 40% celkových genů v Gotlandské proláklině
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165882