0104704 - BFU-R 20043086 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Judit E. - Sanz Miguel, P. J. - Rodríguez-Santiago, L. - Erxleben, A. - Krumm, M. - Sodupe, M. - Šponer, Jiří - Lippert, B.
Metal-mediated deamination of cytosine: experiment and DFT calculations.
[Deaminace cytosinu pomocí kovů: experiment a výpočty DFT.]
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 43, č. 40 (2004), s. 5396-5399. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA MŠMT LN00A016
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: cytosine * deamination * density functional calculations
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 9.161, rok: 2004

A series of cationic PtII complexes of general composition [a3PtC]2+, cis-[a2PtC(OH)]2+, cis-[a2PtC2]2+ and trans-[a2PtCL]n+ (with a = NH3 or a3 = dien; C = 1-methyl-cytosine or 1,5-dimethylcytosine; L = C or other base) has been found to undergo hydrolytic deamination in aqueous solution. The mechanism of the deamination reaction has been enlightened applying DFT (Density Functional Theory) calculations and verified with reference computations at CCSD(T) level of theory. The results of these calculations suggest that the metal at N3 of the cytosine nucleophile acts as a Lewis acid and facilitates the nucleophilic attack of external OH- at the C4 position.

Bylo zjištěno, že sada PtII komplexů obecného složení [a3PtC]2+, cis-[a2PtC(OH)]2+, cis-[a2PtC2]2+ a trans-[a2PtCL]n+ (s a = NH3 nebo a3 = dien; C = 1-metyl-cytosin nebo 1,5-dimetylcytosin; L = C nebo jiná báze) ve vodném prostředí podstupuje hydrolytickou deaminaci. Mechanismus deaminační reakce byl objasněn pomocí DFT výpočtů a verifikován pomocí referenčních výpočtů na úrovni CCSD(T). Výsledky výpočtů naznačují, že kov na pozici N3 cytosinu slouží jako Lewisova kyselina a zprostředkovává nukleofilní atak externí OH-skupiny na pozici C4.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0011970