Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the HsdR subunit of the EcoR124I endonuclease from Escherichia coli

0098095 - ÚVGZ 2008 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lapkouski, Mikalai
Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the HsdR subunit of the EcoR124I endonuclease from Escherichia coli.
[Purifikace, krystalizace a X-ray analýza HsdR podjednotky EcoR124I endonucleázy z E. coli.]
Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications. Roč. 63, č. 7 (2007), s. 582-585. ISSN 1744-3091. E-ISSN 2053-230X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06010
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520
Klíčová slova: DNA translocation
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 0.645, rok: 2007

EcoR124I is a multicomplex enzyme belonging to the type I restriction-modification system from Escherichia coli. Although EcoR124I has been extensively characterized biochemically, there is no direct structural information available about particular subunits. HsdR is a motor subunit that is responsible for ATP hydrolysis, DNA translocation and cleavage of the DNA substrate recognized by the complex. Recombinant HsdR subunit was crystallized using the sitting-drop vapour-diffusion method. Crystals belong to the primitive monoclinic space group, with unit-cell parameters a = 85.75, b = 124.71, c = 128.37 angstrom, beta = 108.14 degrees. Native data were collected to 2.6 angstrom resolution at the X12 beamline of EMBL Hamburg.

EcoR124I je multikomplexní enzym patřící k Typu 1 restrikčně-modifikačních systémů z E.coli. Ačkoliv je EcoR124I charakterizován velmi dobře z biochemického hlediska, neexistují žádné přímé informace o jednotlivých podjednotkách. HsdR je hnací podjednotka, která je odpovědná za hydrolýzu ATP, translokaci DNA a štěpení DNA substrátu rozpoznaného komplexem. HsdR podjednotka byla krystalizována použitím metody sedící kapky založené na difuzy par. Krystaly tvoří primitivní monoklinickou prostorovou grupu s mřížkovými parametry a = 85.75 Ǻ, b = 124.71 Ǻ, c = 128.37 Ǻ, β = 108.14°. Nativní data set byl naměřen do rozlišení 2.6 Ǻ na beamline X12 synchrotronu EMBL/DESY v Hamburku
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0157091