Native proteomic analysis of protein complexes in murine intestinal brush border membranes

0095461 - MBÚ 2008 RIV SIGLE DE eng J - Článek v odborném periodiku
Babušiak, M. - Man, Petr - Petrák, J. - Vyoral, D.
Native proteomic analysis of protein complexes in murine intestinal brush border membranes.
[Nativní proteomická analýza proteinových komplexů hlodavčích kartáčových buněk.]
Proteomics. Roč. 7, č. 1 (2007), s. 121-129. ISSN 1615-9853. E-ISSN 1615-9861
Grant CEP: GA ČR(CZ) GD204/03/H066; GA AV ČR KJB500200612; GA MŠMT LC545
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GA303/04/0003; GA MZd(CZ) NR8930; GA MŠk(CZ) LC06044; CZ(CZ) 023736; GA MZd(CZ) NR8317
Program: NR
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50200510
Klíčová slova: blue native electrophoresis * brush border membranes * protein complexes
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 5.479, rok: 2007

Intestinal epithelial cell protrusions referred as brush border membranes (BBM) are responsible for the digestion, uptake and transport of nutrients, trace elements and vitamins from intestinal lumen into the circulation. In this study, we employed blue native polyacrylamide gel electrophoresis (BN PAGE) technique to separate protein complexes from purified mouse intestinal brush border membranes. We have found 23 distinct protein complexes, which were cut off from the gel and their protein composition was determined by LC-MS/MS. From the identified proteins, 50% represent molecules with at least one predicted transmembrane domain as predicted by SOSUI software. As demonstrated here, BN PAGE is a powerful tool for the separation of not only mitochondrial, but membrane hydrophobic proteins in general. In addition, BN PAGE technique preserves metal-protein interactions, as shown by the presence of 65Zn in metalloprotein complexes, isolated from zinc-radiolabeled brush border membranes

Buňky střevního kartáčového lemu (BBM) zodpovědné za štěpení, příjem a transport živin, stopových prvků a vitamínů do krevního oběhu. V této studii jsme charakterizovali proteinové komplexy z BBM pomocí nativní elektroforézy (BN-PAGE). 23 nalezených komplexů bylo dále analyzováno hmotnostní spektrometrií a bylo určeno jejich složení. Padesát procent nalezených proteinů má, dle analýzy softwarem SOUSI, alespoň jednu transmembránovou doménu. Toto ukazuje, že BN-PAGE je vhodná ne jen k analýze proteinových komplexů, ale i hydrofobních membránových proteinů. Dále se na zinkem značených proteinech podařilo dokázat, že BN-PAGE neporušuje interakce protein-kov. Tato práce je také první popisující proteom BBM
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0155048