Mapping of QTL on chromosome X for fat deposition, muscling and growth traits in a wild boar x Meishan F2 family using a high-density gene map

0090272 - ÚŽFG 2008 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Čepica, Stanislav - Bartenschlager, H. - Geldermann, H.
Mapping of QTL on chromosome X for fat deposition, muscling and growth traits in a wild boar x Meishan F2 family using a high-density gene map.
[Mapování QTL pro ukládání tuku, osvalení a růst na chromozómu X v rodině divoké prase x meishan při použití genové mapy s vysokým rozlišením.]
Animal Genetics. Roč. 38, - (2007), s. 634-638. ISSN 0268-9146. E-ISSN 1365-2052
Grant CEP: GA ČR GA523/04/0106; GA ČR GA523/07/0353
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50450515
Klíčová slova: chromosome X * fatness * growth * mapping * muscling * pig * quantitative trait loci
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.640, rok: 2007

Quantitative trait loci (QTL) for fat deposition, growth and muscling traits have been previously mapped on the basis of low-density linkage maps in a wild boar. Meishan F2 family to the chromosome X region flanked by SW2456 and SW1943. Improved QTL resolution was possible using data for F2 animals with a marker density of 2.7 cM distance in the SW2456 to SW1943 region, including AR, SERPINA7 and ACSL4 as candidate genes. The resolution of the QTL scan was increased substantially, as evidenced by the higher F-ratio values for all QTL. Maxima of F-ratio values for fat deposition, muscling and growth trans were 28.6, 18.2 and 16.5 respectively, and those QTL positions accounted for 7.9%, 5.0% and 4.5% of the F2 phenotypic variance (VF2) respectively. QTL for fatness and growth and for most muscling traits mapped near ACSL4, with the exception of the QTL for ham trans that mapped proximally, in the vicinity of AR. An analysis performed separately for F2 male animals showed the predominant QTL affecting fat deposition traits (up to 13.6% VF2) Near R and two QTL for muscling traits (up to 9.9% VF2) mapped close to ACSL4. In the F2 female animals, QTL affecting muscling (up to 12.1% VF2) mapped at ACSL4 and SW2456, and QTL for fat deposition (10% VF2) and growth (up to 10.5% VF2) mapped at ACSL4.

Lokusy kvantitativních znaků (QTL) pro ukládání tuku, růst a osvalení byly dříve na F2 rodině divoké prase x meishan mapovány na základě map s nízkým rozlišením do oblasti chromozómu X ohraničené mikrosatelity SW2456 a SW1943. Zlepšené rozlišení QTL bylo umožněno použitím dat získaných na F2 zvířatech s využitím genové mapy s rozlišením 2.7 cM v oblasti SW2456 až SW1943, včetně kandidátních genů AR, SERPIN a ACSL4. Zlepšené rozlišení QTL analýzy bylo podstatné, jak dokazují vyšší F hodnoty pro všechny QTL. Maximální F hodnoty pro ukládání tuku, osvalení a růst byly 28,6, 18,2 a 16,5, přičemž tyto QTL vysvětlovaly 7,9, 5,0 a 4,5% fenotypové variability (VF2). QTL pro ukládání tuku, růst a většina QTL pro osvalení se nacházely poblíž ACSL4 s výjimkou QTL pro parametry šunky, které se nacházely proximálně v blízkosti AR. Analýza provedená odděleně pro F2 kastráty ukázala jako predominantní QTL pro ukládání tuku (až 13,5% VF2) v blízkosti AR a dva QTL pro osvalení (až 12,1% VF2) nacházející se v blízkosti ACSL4. U F2 prasniček byly QTL pro osvalení (až 12,1% VF2) lokalizovány do blízkosti ACSL4 a SW2456 a QTL pro ukládání tuku (10% VF2) a růst (až 10,5 VF2) do pozice ACSL4.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0151214