Modification of DNA radiolysis by DNA-binding proteins: Structural aspects

0075976 - ÚJF 2007 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Davídková, Marie - Štísová, Viktorie - Goffinont, S. - Gillard, N. - Castaing, B. - Maurizot, M. S.
Modification of DNA radiolysis by DNA-binding proteins: Structural aspects.
[Vliv proteinů interagujících s DNA na radiolýzu DNA. Strukturní aspekty.]
Radiation Protection Dosimetry. Roč. 122, 1-4 (2007), s. 100-105. ISSN 0144-8420. E-ISSN 1742-3406.
[Symposium on Microdosimetry /14./. Venezia, 13.11.2005-18.11.2005]
Grant CEP: GA MŠMT 1P05OC085
Grant ostatní: GA MŠk(CS1) Barrande 2005-6-018-1
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z10480505
Klíčová slova: specific DNA-protein complexes * radiolysis * ionizing radiation
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 0.528, rok: 2007

The radiolysis of DNA-protein complexes is studied for: 1) the E. coli lactose operator-repressor complex, 2) the complex between DNA bearing an analogue of an abasic site and the repair protein Fpg of Lactococcus Lactis. Experimental patterns of DNA damages are presented and compared to predicted damage distribution obtained using an improved version of the stochastic model RADACK. The same method is used for predicting the location of damages on the proteins.

Radiolýza DNA-proteinových komplexů je studována pro: 1) komplex E. coli lac operatoru s lac represorem, 2) komplex mezi DNA nesoucí analog abasického místa a reparačním proteinem Fpg Lactococcus Lactis. Experimentální distribuce poškození DNA jsou prezentovány a porovnány s predikcemi distribucí poškození získanými aktualizovanou verzí stochastického modelu Radack. Stejná metoda je použita pro predikci poškození v proteinech.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0143192