0029260 - ÚVGZ 2006 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Štys, Dalibor
Secondary structure estimation of recombinant psbH, encoding a photosynthetic membrane protein of cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803.
[Určení sekundární struktury rekombinantního psbH, fotosyntetického membránového proteinu ze sinice Synechocystis sp. PCC 6803.]
Photosynthetica. Roč. 43, č. 3 (2005), s. 421-424. ISSN 0300-3604. E-ISSN 1573-9058
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520; MSM6007665808
Klíčová slova: protein
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 0.810, rok: 2005

The PsbH protein of cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 was expressed as a fusion protein with glutathione-S transferase (GST) in E. coli grown on a mineral medium enriched in 15 N isotope. After enzymatic cleavage of the fusion protein, the H-1-N-15-HSQC spectrum of PsbH protein in presence of the detergent P-D-octyl-glucopyranoside (OG) was recorded on a Bruker DRX 500 MHz NMR spectrometer equipped with a 5 mm TXI cryoprobe to enhance the sensitivity and resolution. Non-labelled protein was used for secondary structure estimation by de-convolution from circular dichroism (CD) spectra. Experimental results were compared with our results from a structural model of PsbH using a restraint-based comparative modelling approach combined with molecular dynamics and energetic modelling. We found that PsbH shows 34-38% alpha-helical structure (ThrM-Ser60), a maximum of around 15 % of beta-sheet,and 12-19 % of P-turn.

Protein PsbH byl exprimován jako fúzní protein s GST kotvou v normálním médiu a v médiu obohaceném 15N. Byla provedena měření CD a NMR v roztocích s detergentem OG. Byla stanovena struktura 15%  skládaný list, 38% helix, zbytek  obrat. Bylo proveden výpočet struktury mimomembránových součástí proteinu, který, při započtení vnitromembránového helixu, dal hodnoty strukrturních motivů ve shodě s experimentem.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0119122