Novel two-step construction of base-modified nucleic acids. Application in electrochemical DNA sensing

0328247 - BFÚ 2010 CZ eng A - Abstract
Fojta, Miroslav - Horáková Brázdilová, Petra - Pivoňková, Hana - Havran, Luděk - Šebest, Peter - Vrábel, Milan - Cahová, Hana - Kalachová, Lubica - Riedl, Jan - Raindlová, Veronika - Hocek, Michal
Novel two-step construction of base-modified nucleic acids. Application in electrochemical DNA sensing.
[Nová dvoustupňová konstrukce modifikovaných DNA. Aplikace v elektrochemické detekci DNA.]
Abstracts. Prague, 2009. s. 277. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658.
[34th FEBS Congress: Life's Molecular Interactions. 04.07.2009-09.07.2009, Prague]
R&D Projects: GA AV ČR(CZ) IAA400040901; GA ČR(CZ) GA203/09/0317; GA MŠMT(CZ) LC06035
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702; CEZ:AV0Z40550506
Keywords : labeled nucleic acid * electrochemical method * DNA-polymerases
Subject RIV: BO - Biophysics

Labeled nucleic acids are usually prepared via multistep chemical synthesis of oligonucleotides (ON). Recently we have introduced a novel two-step construction of modified ON, relying in direct aqueous cross-coupling of halogenated deoxynucleoside triphosphates (dNTP) with various functional groups and enzymatic incorporation of the nucleotide conjugates into ON by DNA polymerases. We thus obtained a complete set of four nucleobases bearing electrochemically distinguishable tags.

Značené nukleové kyseliny jsou obvykle připravovány multi-krokovou syntézou oligonukleotidů (ON). Nyní jsme představili novou dvou-krokovou konstrukci modifikovaných ON spočívající v přímém spojování halogenovaných deoxynukleosid-trifosfátů (dNTP) s různými funkčními skupinami a enzymatické inkorporaci nukleotidových konjugátů do ON pomocí DNA polymerát. Získali jsme kompletní sadu čtyř nukleobází nesoucích elektrochemicky odlišitelné značky.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0174605