0104705 - BFU-R 20043087 RIV US eng J - Journal Article
Šponer, Jiří - Jurečka, Petr - Hobza, Pavel
Accurate interaction energies of hydrogen-bonded nucleic acid base pairs.
[Přesné interakční energie párů nukleových kyselin spojených vodíkovou vazbou.]
Journal of the American Chemical Society. Roč. 126, č. 32 (2004), s. 10142-10151. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
R&D Projects: GA MŠMT LN00A032
Grant - others:Wellcome Trust(GB) GR067507MF
Institutional research plan: CEZ:AV0Z5004920
Keywords : hydrogen-bonded nucleic acid base pairs * binding enerigy * basis-set calculations
Subject RIV: BO - Biophysics
Impact factor: 6.903, year: 2004

Hydrogen-bonded nucleic acids base pairs substantially contribute to the structure and stability of nucleic acids. The study presents reference ab initio structures and interaction energies of selected base pairs with binding energies ranging from -5 to -47 kcal/mol. The molecular structures are obtained using the RI-MP2 method with extended cc-pVTZ basis set of atomic orbitals. The interaction energies are calculated using the Complete Basis Set (CBS) extrapolation at the RI-MP2 level.

Páry bází spojené vodíkovými vazbami podstatně přispívají ke struktuře a stabilitě nukleových kyselin. Studie představuje referenční ab initio struktury a interakční energie vybraných párů bází v rozsahu vazebných energií od -5 do -47 kcal/mol. Molekulové struktury byly získány pomocí RI-MP2 metody s rozšířenou bází atomových orbitalů. Interakční energie byly vypočteny pomocí CBS extrapolace na úrovni RI-MP2.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0011971