Search results
- 1.0581638 - ÚMG 2025 RIV CH eng J - Journal Article
Redčenko, Oleksij - Tůmová, Magda - Dráber, Petr
Simplified PCR-Based Quantification of Proteins with DNA Aptamers and Methylcellulose as a Blocking Agent.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 25, č. 1 (2024), č. článku 347. ISSN 1661-6596
R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TG01010066; GA TA ČR TP01010060; GA TA ČR TA01010436; GA ČR(CZ) GA23-07736S; GA MPO FV20479; GA MŠMT LM2023052
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : blocking agents * DNA aptamers * immunoglobulins * methylcellulose * polymerase chain reaction * polypropylene wells
OECD category: Biochemistry and molecular biology
Impact factor: 5.6, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://mdpi.com/1422-0067/25/1/347
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0349748 - 2.0573113 - ÚŽFG 2024 RIV AU eng J - Journal Article
Vymazalová, K. - Šerý, Omar - Králík, Petr - Dziedzinská, Radka - Musilová, Z. - Frišhons, J. - Vojtíšek, T. - Joukal, M.
Substantial decrease in SARS-CoV-2 RNA after fixation of cadavers intended for anatomical dissection.
ANATOMICAL SCIENCE INTERNATIONAL. Roč. 98, č. 3 (2023), s. 441-447. ISSN 1447-6959. E-ISSN 1447-073X
R&D Projects: GA MV(CZ) VI04000071
Institutional support: RVO:67985904
Keywords : Embalming * Dissection * Infections * Coronavirus * Polymerase chain reaction
OECD category: Epidemiology
Impact factor: 1.2, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s12565-023-00707-9
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0343696 - 3.0556379 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Journal Article
Filipi, Kateřina - Rahman, Waheed Ur - Osičková, Adriana - Osička, Radim
Kingella kingae RtxA Cytotoxin in the Context of Other RTX Toxins.
Microorganisms. Roč. 10, č. 3 (2022), č. článku 518. E-ISSN 2076-2607
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA22-15825S
Institutional support: RVO:61388971
Keywords : escherichia-coli-hemolysin * adenylate-cyclase toxin * aggregatibacter-actinomycetemcomitans leukotoxin * pasteurella-haemolytica leukotoxin * real-time pcr * polymerase-chain-reaction * outer-membrane vesicles * bordetella-pertussis cyaa * terminal secretion signal * cell-invasive activity * beta(2) integrins * Kingella kingae * membrane * pore-forming * RtxA * RTX toxin
OECD category: Microbiology
Impact factor: 4.5, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://www.mdpi.com/2076-2607/10/3/518
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0331349 - 4.0555293 - BC 2022 RIV AU eng J - Journal Article
Blanvillain, C. - Saavedra, S. - Withers, T. - Votýpka, Jan - Laroucau, K. - Lowenski, S. - Modrý, David
Screening of diseases in wild exotic birds on Tahiti Island implications for French Polynesian conservation.
Pacific Conservation Biology. Roč. 27, č. 3 (2021), s. 284-295. ISSN 1038-2097. E-ISSN 2204-4604
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : polymerase-chain-reaction * new-zealand * plasmodium-relictum * malaria parasites * avian malaria * biogeography * assay * virulence * pigeons * doves
OECD category: Microbiology
Method of publishing: Limited access
https://www.publish.csiro.au/pc/PC20049
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0329811 - 5.0541652 - ÚBO 2022 RIV GB eng J - Journal Article
Seidlová, V. - Syrová, E. - Minářová, H. - Zukal, Jan - Baláž, V. - Němcová, M. - Papežíková, I. - Pikula, J. - Schmidt-Posthaus, H. - Mareš, J. - Palíková, M.
Comparison of diagnostic methods for Tetracapsuloides bryosalmonae detection in salmonid fish.
Journal of Fish Diseases. Roč. 44, č. 8 (2021), s. 1147-1153. ISSN 0140-7775. E-ISSN 1365-2761
Institutional support: RVO:68081766
Keywords : diagnostic sensitivity * diagnostic specificity * immunohistochemistry * polymerase chain reaction * prevalence * proliferative kidney disease
OECD category: Marine biology, freshwater biology, limnology
Impact factor: 2.580, year: 2021
Method of publishing: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jfd.13375
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0319187File Download Size Commentary Version Access 0541652.pdf 0 541.5 KB Publisher’s postprint open-access - 6.0541316 - BTÚ 2021 RIV US eng J - Journal Article
Žucha, Daniel - Androvič, Peter - Kubista, Mikael - Valihrach, Lukáš
Performance Comparison of Reverse Transcriptases for Single-Cell Studies.
Clinical Chemistry. Roč. 66, č. 1 (2020), s. 217-228. ISSN 0009-9147. E-ISSN 1530-8561
Institutional support: RVO:86652036
Keywords : polymerase-chain-reaction * gene-expression * cdna synthesis * rt-qpcr * generation
OECD category: Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis
Impact factor: 8.327, year: 2020
Method of publishing: Open access
https://academic.oup.com/clinchem/article/66/1/217/5688842
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0318894 - 7.0540516 - ÚMG 2021 RIV CZ cze Z - Pilot plant, v. technol., variety, breed
Tůmová, Magda - Dráber, Petr - Dráber, M.
Ověřená technologie přípravy komponent soupravy pro zjednodušenou kvantifikaci genové exprese.
[Verified technology for preparation of kit components for simplified quantification of gene expression.]
Internal code: R-qPCR COMP ; 2020
Technical parameters: Jedná se o technologii přípravy reakčních směsí vhodných pro kvantifikaci RNA pomoci R-qPCR. Reakční směsi musí vykazovat vzájemnou kompatibilitu, aby byly použitelné v jedno-zkumavkovém formátu, který zahrnuje hybridizaci DNA sond na studovanou RNA (mRNA, virovou RNA a další) v roztoku H, následnou ligaci DNA sond zakotvených na RNA v roztoku L a poté kvantifikace ligovaných molekul pomocí qPCR za použití interkalačních barviv v roztoku I, nebo hydrolyzačních sond v roztoku S. Kompatibilita jednotlivých etap procesu R-qPCR byla výsledkem kombinace unikátních reagens, které jsou specifikovány v přihlášce vynálezu z tohoto projektu a z části vycházejí z publikace jednoho z řešitelů tohoto projektu (P.D, 1,2-propanediol-trehalose mixture as a potent quantitative real-time PCR enhancer, BMC Biotechnology 11:414, 2011).
Economic parameters: Jedná se o technologii přípravy reakčních směsí využitelných pro R-qPCR. Tato technologoie bude využita při přípravě souprav s prodejem na domácím trhu v objemu jednotek 1000 ks ročně na domácím trhu s prodejem z domácího trhu v jednotkách miliónů Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0318138 - 8.0540338 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Dráber, Petr - Dráber, M.
Univerzální souprava R-qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1.
[Universal kit for R-qPCR with intercalation dye SYBR Green 1.]
Internal code: R-qPCR-UNIVERSAL SYBR ; 2020
Technical parameters: Jedná se o univerzální soupravu R-qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1. Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R- qPCR Master Mix se SYBR Green barvivem a 3) DNA ligázu (SplintR). Souprava neobsahuje DNA sondy, ale obsahuje návod na navržení optimálních DNA sond. Soupravu bude vyrábět Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, která se podílela na řešení projektu.
Economic parameters: Univerzálních R-qPCR souprav s využitím SYBR Green 1 se může ročně prodat až několik tisíc kusů ročně se ziskem z domácího trhu v jednotkách jednotek miliónů Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0318210 - 9.0540335 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Dráber, Petr - Dráber, M.
Univerzální souprava R-qPCR s využitím hydrolyzační sondy.
[Universal kit for R-qPCR with hydrolysis probe.]
Internal code: R-qPCR-HYDROLYSIS PROBE ; 2020
Technical parameters: Jedná se o univerzální soupravu R-qPCR s využitím hydrolyzačních sond. Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R-qPCR Master Mix pro použití s hydrolyzační sondou a 3) DNA ligázu (SplintR). Souprava neobsahuje DNA sondy, amplifikační primery a hydrolyzační sondu, ale obsahuje návod na navržení optimálních DNA sond. Soupravu bude vyrábět Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, která se podílela na řešení projektu.
Economic parameters: Univerzálních R-qPCR souprav s využitím hydrolyzační sondy se může ročně prodat až několik tisíc kusů ročně se ziskem z domácího trhu v jednotkách miliónů Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0317978 - 10.0540334 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Dráber, Petr - Dráber, M.
Souprava pro kvantifikaci exprese vybraného genu, mTNF-α.
[Kit for quantification of selected gene expression, mTNF-α.]
Internal code: sQPCR-TNF-α ; 2020
Technical parameters: Jedná se o soupravu pro stanovení mRNA pro TNF-α: Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R-qPCR Master Mix se SYBR Green barvivem, 3) DNA ligázu (SplintR) a 4) DNA sondy L a R. Jedná se o dva syntetické oligonukleotidy DNA, jejichž sekvence jsou komplementární k TNF-α mRNA a navazují bezprostředně na sebe. Sekvence každé sondy na jednom konci pokračuje sekvencí pro nasedání primerů při qPCR detekci. Tyto amplifikační primery jsou rovněž součástí soupravy. Souprava bude vyráběna ve společnosti Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, které se podílelo na řešení projektu.
Economic parameters: Jedná se o stanovení unikátní mRNA s využitím až stovek souprav ročně na domácím trhu se ziskem z domácího trhu v jednotkách stovek tisíc Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0317977