Search results
- 1.0581624 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Journal Article
Šlachtová, Veronika - Bellová, Simona - Vrábel, Milan
Synthesis of C3-Substituted N1-tert-Butyl 1,2,4-Triazinium Salts via the Liebeskind–Srogl Reaction for Fluorogenic Labeling of Live Cells.
Journal of Organic Chemistry. (2024). ISSN 0022-3263. E-ISSN 1520-6904
R&D Projects: GA ČR(CZ) GF20-30494L; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institutional support: RVO:61388963
Keywords : liebeskind-Srogl cross-coupling * triazinium ligation * strained alkyne * bioorthogonal labeling * fluorogenic reaction
Impact factor: 3.6, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.joc.3c02454
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0349735File Download Size Commentary Version Access 10.1021acs.joc.3c02454.pdf 1 3 MB Publisher’s postprint open-access - 2.0557062 - FGÚ 2023 RIV CH eng J - Journal Article
Sedmera, David
HLHS: Power of the Chick Model.
Journal of cardiovascular development and disease. Roč. 9, č. 4 (2022), č. článku 113. E-ISSN 2308-3425
R&D Projects: GA MZd(CZ) NU21-02-00402
Institutional support: RVO:67985823
Keywords : left atrial ligation * left ventricular hypoplasia * hemodynamic alteration * myocyte proliferation * embryonic myocardium
OECD category: Cardiac and Cardiovascular systems
Impact factor: 2.4, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://www.mdpi.com/2308-3425/9/4/113
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0331173 - 3.0551546 - ÚEM 2022 RIV CH eng J - Journal Article
Nojima, K. - Miyazaki, H. - Hori, T. - Vargová, Lýdia - Oohashi, T.
Assessment of Possible Contributions of Hyaluronan and Proteoglycan Binding Link Protein 4 to Differential Perineuronal Net Formation at the Calyx of Held.
Frontiers in Cell and Developmental Biology. Roč. 9, sep. (2021), č. článku 730550. ISSN 2296-634X. E-ISSN 2296-634X
Institutional support: RVO:68378041
Keywords : perineuronal net * chondroitin sulfate proteoglycan * calyx of Held * hyaluronan and proteoglycan binding link protein 4 * synapse * in situ proximity ligation assay
OECD category: Neurosciences (including psychophysiology
Impact factor: 6.081, year: 2021
Method of publishing: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2021.730550/full
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0326820 - 4.0540516 - ÚMG 2021 RIV CZ cze Z - Pilot plant, v. technol., variety, breed
Tůmová, Magda - Dráber, Petr - Dráber, M.
Ověřená technologie přípravy komponent soupravy pro zjednodušenou kvantifikaci genové exprese.
[Verified technology for preparation of kit components for simplified quantification of gene expression.]
Internal code: R-qPCR COMP ; 2020
Technical parameters: Jedná se o technologii přípravy reakčních směsí vhodných pro kvantifikaci RNA pomoci R-qPCR. Reakční směsi musí vykazovat vzájemnou kompatibilitu, aby byly použitelné v jedno-zkumavkovém formátu, který zahrnuje hybridizaci DNA sond na studovanou RNA (mRNA, virovou RNA a další) v roztoku H, následnou ligaci DNA sond zakotvených na RNA v roztoku L a poté kvantifikace ligovaných molekul pomocí qPCR za použití interkalačních barviv v roztoku I, nebo hydrolyzačních sond v roztoku S. Kompatibilita jednotlivých etap procesu R-qPCR byla výsledkem kombinace unikátních reagens, které jsou specifikovány v přihlášce vynálezu z tohoto projektu a z části vycházejí z publikace jednoho z řešitelů tohoto projektu (P.D, 1,2-propanediol-trehalose mixture as a potent quantitative real-time PCR enhancer, BMC Biotechnology 11:414, 2011).
Economic parameters: Jedná se o technologii přípravy reakčních směsí využitelných pro R-qPCR. Tato technologoie bude využita při přípravě souprav s prodejem na domácím trhu v objemu jednotek 1000 ks ročně na domácím trhu s prodejem z domácího trhu v jednotkách miliónů Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0318138 - 5.0540338 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Dráber, Petr - Dráber, M.
Univerzální souprava R-qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1.
[Universal kit for R-qPCR with intercalation dye SYBR Green 1.]
Internal code: R-qPCR-UNIVERSAL SYBR ; 2020
Technical parameters: Jedná se o univerzální soupravu R-qPCR s využitím interkalačního barviva SYBR Green 1. Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R- qPCR Master Mix se SYBR Green barvivem a 3) DNA ligázu (SplintR). Souprava neobsahuje DNA sondy, ale obsahuje návod na navržení optimálních DNA sond. Soupravu bude vyrábět Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, která se podílela na řešení projektu.
Economic parameters: Univerzálních R-qPCR souprav s využitím SYBR Green 1 se může ročně prodat až několik tisíc kusů ročně se ziskem z domácího trhu v jednotkách jednotek miliónů Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0318210 - 6.0540335 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Dráber, Petr - Dráber, M.
Univerzální souprava R-qPCR s využitím hydrolyzační sondy.
[Universal kit for R-qPCR with hydrolysis probe.]
Internal code: R-qPCR-HYDROLYSIS PROBE ; 2020
Technical parameters: Jedná se o univerzální soupravu R-qPCR s využitím hydrolyzačních sond. Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R-qPCR Master Mix pro použití s hydrolyzační sondou a 3) DNA ligázu (SplintR). Souprava neobsahuje DNA sondy, amplifikační primery a hydrolyzační sondu, ale obsahuje návod na navržení optimálních DNA sond. Soupravu bude vyrábět Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, která se podílela na řešení projektu.
Economic parameters: Univerzálních R-qPCR souprav s využitím hydrolyzační sondy se může ročně prodat až několik tisíc kusů ročně se ziskem z domácího trhu v jednotkách miliónů Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0317978 - 7.0540334 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Dráber, Petr - Dráber, M.
Souprava pro kvantifikaci exprese vybraného genu, mTNF-α.
[Kit for quantification of selected gene expression, mTNF-α.]
Internal code: sQPCR-TNF-α ; 2020
Technical parameters: Jedná se o soupravu pro stanovení mRNA pro TNF-α: Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R-qPCR Master Mix se SYBR Green barvivem, 3) DNA ligázu (SplintR) a 4) DNA sondy L a R. Jedná se o dva syntetické oligonukleotidy DNA, jejichž sekvence jsou komplementární k TNF-α mRNA a navazují bezprostředně na sebe. Sekvence každé sondy na jednom konci pokračuje sekvencí pro nasedání primerů při qPCR detekci. Tyto amplifikační primery jsou rovněž součástí soupravy. Souprava bude vyráběna ve společnosti Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, které se podílelo na řešení projektu.
Economic parameters: Jedná se o stanovení unikátní mRNA s využitím až stovek souprav ročně na domácím trhu se ziskem z domácího trhu v jednotkách stovek tisíc Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0317977 - 8.0540333 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Cahová, M. - Dráber, Petr - Dráber, M.
Souprava pro kvantifikaci exprese vybraného genu, PNPLA3.
[Kit for quantification of the selected gene expression, PNPLA3.]
Internal code: R-qPCR_PNPLA3_WT-SYBR ; 2020
Technical parameters: Jedná se o soupravu pro stanovení mRNA pro PNPLA3 WT: Souprava obsahuje 1) HL pufr pro hybridizaci a ligaci, 2) R-qPCR Master Mix se SYBR Green barvivem, 3) DNA ligázu (SplintR) a 4) DNA sondy L a R. Jedná se o dva syntetické oligonukleotidy DNA, jejichž sekvence jsou komplementární ke stanovované mRNA a navazují bezprostředně na sebe. Sekvence každé sondy na jednom konci pokračuje sekvencí pro nasedání primerů pro qPCR detekci. Tyto amplifikační primery jsou rovněž součástí soupravy. Souprava bude vyráběna ve společnosti Top-Bio, s.r.o., sídlící ve Vestci, Průmyslová 596, PSČ 25250, které se podílelo na řešení projektu, případně bude po udělení podaného patentu, nabídnuta na licenčním základě zájemcům.
Economic parameters: Jedná se o stanovení unikátní PNPLA3 mRNA s využitím až stovek souprav ročně na domácím trhu se ziskem z domácího trhu v jednotkách stovek tisíc Kč.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Quantification of gene expression * DNA ligase * quantitattive polymerase chain reaction * enhancers of PCR and DNA ligation
OECD category: Human genetics
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0317976 - 9.0534593 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Cahová, M. - Dráber, M. - Dráber, Petr
R-qPCR-PNPLA3 Kit, prototyp soupravy pro kvantifikaci PNPLA3 RNA.
[R-qPCR-PNPLA3 Kit, a prototype of the kit for PNPLA3 RNA quantification.]
Internal code: FV20479-1 PNPLA3 ; 2020
Technical parameters: R-qPCR-PNPLA3 Kit je souprava která je optimalizovaná z hlediska složení a způsobu užití na průkaz PNPLA3 RNA ligační metodou. V současné době se jedná o možnosti komerčního využití této soupravy u příjemce dotace, firmy Top-Bio, s.r.o., IČO 64578895, Průmyslová 596, 252 50 Vestec, Tel. 603476934
Economic parameters: Uvedením soupravy na trh může dojít k zvýšení objemu výroby a zisku výrobců souprav pro stanovení PNPLA3 RNA.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Gene expression * PNPLA3 * RNA quantification * polymerase chain reaction * SYBR green I * ligation of DNA probes * quantitative PCR
OECD category: Biochemistry and molecular biology
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0312763 - 10.0534591 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Dráber, M. - Dráber, Petr
R-qPCR-SYBR Kit, prototyp univerzální soupravy pro kvantifikaci RNA ligační metodou.
[R-qPCR-SYBR Kit, a prototype of a universal kit for RNA quantification by the ligation method
.]
Internal code: FV20479-1 SYBR ; 2020
Technical parameters: R-qPCR-SYBR Kit je univerzální souprava která je optimalizovaná z hlediska složení a způsobu užití na průkaz RNA ligační metodou. V současné době se jedná o možnosti komerčního využití této univerzální soupravy u příjemce dotace, firmy Top-Bio, s.r.o., IČO 64578895, Průmyslová 596, 252 50 Vestec, Tel. 603476934
Economic parameters: Uvedením soupravy na trh může dojít k zvýšení objemu výroby a zisku výrobců souprav pro stanovení RNA.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Gene expression * RNA quantification * polymerase chain reaction * SYBR green I * ligation of DNA probes * quantitative PCR
OECD category: Biochemistry and molecular biology
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0312761