Search results
- 1.0580359 - ÚPT 2024 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Láznička, Tomáš - Hrubanová, Kamila - Ježek, Jan - Krzyžánek, Vladislav
Mikrofluidní čip umožňující mrazovou analýzu pomocí Ramanovy spektroskopie a cryo-SEM.
[Microfluidic chip enabling frost analysis by Raman spectroscopy and cryo-SEM.]
Internal code: APL-2023-07 ; 2023
Technical parameters: Hlavními složkami mikrofluidního čipu jsou dvě tenké fólie z polydimethylsiloxanu (PDMS) o rozměrech 18x12 mm a tloušťce 200 µm. V jedné z fólií jsou pomocí litografie vytvořeny dva kanály o hloubce 40 um a šířce 200, které ústí do komory o průměru 1 mm a prochází skrz celou fólii. Obě fólie jsou k sobě spojeny pomocí kyslíkové plazmy tak, aby byly vytvořené kanálky uzavřeny. Stejným způsobem je k tenké fólii obsahující komoru (a uzavírá ji z druhé strany) připevněn safírový disk umožňující kontinuální pozorování kapalin. Dalším důležitým prvkem, který je následně k čipu připevněn jsou vstupní porty, kterými je kapalina přiváděna a odváděna z chipu, ty přidávají mikrofluidnímu čipu na své výšce, která je ve výsledku 6 mm.
Economic parameters: Funkční vzorek realizovaný při řešení grantu, s předpokladem smluvního využití s vědeckým a ekonomickým přínosem i po jeho ukončení. Kontakt: Mgr. Kamila Hrubanová, Ph.D., hrubanova@isibrno.cz.
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LM2023050
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM100652102
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : microfluidic chip * Raman spectroscopy * SEM * cryo-SEM
OECD category: Nano-processes (applications on nano-scale)
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0349149 - 2.0568569 - ÚPT 2023 RIV CZ eng A - Abstract
Láznička, Tomáš - Hrubanová, Kamila - Ježek, Jan - Kizovský, Martin - Bernatová, Silvie - Mrázová, Kateřina - Obruča, S. - Zemánek, Pavel - Krzyžánek, Vladislav
Assembly for Cryo-SEM/Raman Microspectroscopy sample analysis.
16th Multinational Congress on Microscopy, 16MCM, 04-09 September 2022, Brno, Czech Republic. Book of abstracts. Brno: Czechoslovak Microscopy Society, 2022 - (Krzyžánek, V.; Hrubanová, K.; Hozák, P.; Müllerová, I.; Šlouf, M.). s. 63-64. ISBN 978-80-11-02253-2.
[Multinational Congress on Microscopy /16./. 04.09.2022-09.09.2022, Brno]
R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TN01000008
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM100652102
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : Cryo-SEM * Raman spectroscopy * electron microscopy
OECD category: Electrical and electronic engineering
https://www.16mcm.cz/wp-content/uploads/2022/09/16MCM-abstract-book.pdf
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0339859 - 3.0566637 - ÚPT 2023 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Láznička, Tomáš - Krutil, Vojtěch - Krzyžánek, Vladislav - Hrubanová, Kamila
Kryo-stolek a antikontaminátor pro FIB-SEM.
[Cryo-stage and anti-contaminator for FIB-SEM.]
Internal code: APL-2022-24 ; 2022
Technical parameters: Kryo-stolek umožňující uchycení komerčního držáku vzorku je k posuvnému mechanismu mikroskopu připevněn pomocí centrovacích kolíků a jednoho šroubu uprostřed stolku. Otvor pro hlavičku šroubu je průchozí skrz držák, takže není nutné rozebírat celý stolek. Část stolku, do které se upevňuje držák vzorku je připevněna ke spodní podložce pomocí čtyř sloupků Antikontaminační štít vzorku je připevněn ke spodní podložce dvěma podobnými, delšími sloupky. Antikontaminační štít může být pomocí chladovodu připojen zjednodušenou cestou buď k velkému antikontaminačnímu štítu ze zadní strany nebo přímo na palec (k držáku nebo chladovodu vedoucí od palce) chladící Dewarovy nádoby. Součástí systému je měřič teploty připojený k pravé části, z levé části je připojen ohřívač, kterým můžeme regulovat teplotu vzorku. Systém je schopen dosáhnout teoretické teploty 81 K. Posuvný mechanismus i se stolkem mikroskopu je schopný náklonu do 52°, který slouží pro náklon vzorku ve směru k iontovému svazku pro kolmé obrábění svazkem k povrchu vzorku.
Economic parameters: Funkční vzorek realizovaný při řešení grantu, s předpokladem smluvního využití s vědeckým a ekonomickým přínosem i po jeho ukončení. Kontakt: Mgr. Kamila Hrubanová, Ph.D., hrubanova@isibrno.cz.
R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TN01000008
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : Cryo-SEM * electron microscopy * FIB-SEM
OECD category: Electrical and electronic engineering
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0337951 - 4.0552527 - ÚPT 2022 RIV US eng A - Abstract
Hrubanová, Kamila - Mrázová, Kateřina - Urban, Pavel - Krutil, Vojtěch - Skoupý, Radim - Obruča, S. - Krzyžánek, Vladislav
Freeze-fracturing of microbes producing biopolymers at liquid Helium temperature: cryo-SEM application in biotechnology.
Microscopy and Microanalysis. Cambridge University Press. Roč. 27, S1 (2021), s. 3164-3166. ISSN 1431-9276. E-ISSN 1435-8115
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA19-20697S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM100652102
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : cryo-SEM * biopolymers * liquid Helium * biotechnology
OECD category: Electrical and electronic engineering
https://www.cambridge.org/core/journals/microscopy-and-microanalysis/article/freezefracturing-of-microbes-producing-biopolymers-at-liquid-helium-temperature-cryosem-application-in-biotechnology/50BC0DD9DE37425C157D7C740B5DE39A
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0327637 - 5.0550701 - ÚPT 2022 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Hrubanová, Kamila - Láznička, Tomáš - Krzyžánek, Vladislav - Samek, Ota
Držák vzorků pro FIB-SEM umožňující analýzu vzorku při nízkých teplotách.
[A sample holder for FIB-SEM at low temperature.]
Internal code: APL-2021-10 ; 2021
Technical parameters: Kryo-držák s antikontaminátorem je navržen pro účely pozorování hluboce zamražených vzorků v rastrovacích elektronových mikroskopech (SEM) vybavených kryo-systémem typu Bal-Tec (Balzers, Lichtenštajnsko) a Leica microsystems (Vídeň, Rakousko). Držák je uzpůsoben pro uchycení kovových terčíků používaných v systémech pro vysokotlaké mražení High Pressure Freezing (HPF), výrobců Leica microsystems (Vídeň, Rakousko) a Engineering Office M. Wohlwend GmbH (Sennwald, Švýcarsko), a to tak, aby bylo možné pozorování jak pomocí detektorů sekundárních a zpětně odražených elektronů, tak pro použití v mikroskopech typu FIB-SEM. Kryo-držák je navržen takovým způsobem, aby jej bylo možné přenášet pomocí kryo-vakuového transferu VCT100 (Bal-Tec, Balzers, Lichtenštajnsko a Leica microsystems, Vídeň, Rakousko), tzn. je zachována jeho kompatibilita s přenosnou tyčí transferu. Z důvodu využití pro korelativní zobrazování s Ramanovým mikrospektrometrem (InVia, Renishaw) je horní, vyměnitelná část držáku opatřena značkami (viz. Technická dokumentace). Kryo-držák umožňuje pevné uchycení dvou HPF terčíku o průměru 3 nebo 6 mm v závislosti na jeho variantě, pevné uchycení HPF terčíku je vyřešeno pomocí svěracího mechanismu a to tak, že při zašroubování stavěcího šroubu sevře stolek terčík mezi svými čelistmi. Součástí kryo-držáku je antikontaminátor – pohyblivý štít, který se při přenosu překlopí nad uchycené vzorky pomocí otočného pohybu tyčí, která je součástí transferu VCT100 (Leica microsystems).
Economic parameters: Funkční vzorek realizovaný při řešení grantu, s předpokladem smluvního využití s vědeckým a ekonomickým přínosem i po jeho ukončení. Kontakt: Mgr. Kamila Hrubanová, Ph.D., hrubanova@isibrno.cz.
R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TN01000008
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : Cryo-SEM * Raman spectroscopy * electron microscopy * FIB-SEM
OECD category: Electrical and electronic engineering
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0326006 - 6.0536415 - ÚPT 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Hrubanová, Kamila - Ježek, Jan - Láznička, Tomáš - Krzyžánek, Vladislav - Králík, Tomáš - Bernatová, Silvie
Sestava pro korelační analýzu vzorků pomocí kryogenní rastrovací elektronové mikroskopie (cryo-SEM) a Ramanovy mikro-spektroskopie.
[The tool for correlation of cryo-SEM and cryo-Raman spectroscopy.]
Internal code: APL-2020-05 ; 2020
Technical parameters: Sestava umožňuje pevné uchycení tří druhů držáků vzorků, díky tomu je kompatibilní se třemi komerčními systémy pro kryogenní přípravu vzorku pro cryo-SEM (Leica microsystems, Gatan nebo Quorum). Místo pro umístění těchto držáků vzorků je vyrobeno pomocí 3D tisku z teplotně odolného plastu (ABS). Tato část je umístěna v Dewarově nádobě a obsahuje také uchycení teplotního čidla typu PT100 pro měření hladiny tekutého kryogenu. Odnímatelná Dewarova nádoba je na své spodní části vybavena podstavcem pro přesné posazení na motorizovaný posuvný systém. Sestava motorizovaného posuvného systému umožňující velmi přesný piezo-posuv v ose X a Y je pevně přichycena k ramenu, které je kompatibilní s tělem Ramanova mikro-spektrometru InVia (Renishaw). Díky geometrii tohoto ramena je možné využít originální posuv mikroskopu v ose Z. Rameno je připevněno třemi šrouby. Součástí sestavy je kryt objektivu vyrobený pomocí 3D tisku, jehož součástí je kryt, který je velmi stabilní i při teplotách blížících se teplotě tekutého dusíku při atmosférickém tlaku. Jeho hlavním úkolem je minimalizovat kontaminace způsobené kondenzací vzdušné vlhkosti.
Economic parameters: Funkční vzorek realizovaný při řešení grantu, s předpokladem smluvního využití s vědeckým a ekonomickým přínosem i po jeho ukončení. Kontakt: Mgr. Kamila Hrubanová, Ph.D., dobranska@isibrno.cz
R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TN01000008
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : Cryo-SEM * Raman spectroscopy * electron microscopy
OECD category: Electrical and electronic engineering
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0314183 - 7.0535208 - ÚPT 2021 RIV CZ cze J - Journal Article
Hrubanová, Kamila - Mrázová, Kateřina - Obruča, S. - Samek, Ota - Nebesářová, Jana - Šlouf, Miroslav - Krzyžánek, Vladislav
Studium PHA produkujících mikroorganismů pomocí kombinace cryo-SEM, TEM a Ramanovy spektroskopie.
[The study of PHA producing microorganism using a combination of cryo-SEM, TEM and Raman spectroscopy.]
Jemná mechanika a optika. Roč. 65, č. 6 (2020), s. 179-181. ISSN 0447-6441
R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TN01000008
Institutional support: RVO:68081731 ; RVO:60077344 ; RVO:61389013
Keywords : cryo-SEM * TEM * cyanobacteria * Raman spectroscopy
OECD category: Electrical and electronic engineering; Optics (including laser optics and quantum optics) (BC-A); Polymer science (UMCH-V)
Method of publishing: Limited access
https://jmo.fzu.cz/sites/jmo.fzu.cz/files/oldweb/2020/2020-06/jmo_20_06_obsah.pdf
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0313291 - 8.0524886 - ÚPT 2021 RIV CZ eng C - Conference Paper (international conference)
Adámková, Kateřina - Trudicová, M. - Hrubanová, Kamila - Sedláček, P. - Krzyžánek, Vladislav
An appropriate method for assessing hydrogel pore sizes by cryo-sem.
10th Anniversary International Conference on Nanomaterials - Research and Application (NANOCON 2018). Ostrava: Tanger, 2019, s. 415-420. ISBN 978-80-87294-89-5.
[Anniversary International Conference on Nanomaterials - Research and Application (NANOCON) /10./. Brno (CZ), 17.10.2018-19.10.2018]
R&D Projects: GA ČR GA17-15451S; GA MŠMT(CZ) LO1212; GA MŠMT ED0017/01/01
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : hydrogelcryo-SEM * agarose * cryo-SEM * freezing methods * image analysis
OECD category: Polymer science
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0309123 - 9.0501298 - ÚPT 2019 CZ eng A - Abstract
Vaškovicová, Naděžda - Kováčiková, M. - Valigurová, A. - Diakin, A. - Krzyžánek, Vladislav
Cryo-SEM of Cell Cortex Architecture and Membrane Ultrastructure in Eugregarines.
Mikroskopie 2018. Praha: Československá mikroskopická společnost, 2018. s. 76.
[Mikroskopie 2018. 14.05.2018-16.05.2018, Lednice na Moravě]
R&D Projects: GA ČR GA17-15451S; GA MŠMT(CZ) LO1212; GA MŠMT ED0017/01/01
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : Cryo-SEM * Eugregarines * freeze-fracture * filamentous structures * cytoplasmic organelles
OECD category: Electrical and electronic engineering
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0293290 - 10.0500461 - ÚPT 2019 RIV CZ cze J - Journal Article
Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav
Inovativní metodika mrazového lámání a cryo-SEM demonstrovaná na biofilmu Candidy parapsilosis.
[Innovative methodology of freeze-fracturing and cryo-SEM demontrated on Candida parapsilosis biofilm.]
Jemná mechanika a optika. Roč. 64, č. 1 (2019), s. 15-17. ISSN 0447-6441
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LO1212
Institutional support: RVO:68081731
Keywords : cryo-SEM * freeze fracturing * biofilm
OECD category: Applied mechanics
Method of publishing: Limited access
https://fyzika.upol.cz/cs/akce-pro-verejnost/casopis-jemna-mechanika-optika
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0292526