Search results
- 1.0546949 - MBÚ 2022 RIV US eng J - Journal Article
Mujakić, Izabela - Andrei, Adrian-Stefan - Shabarova, Tatiana - Kolesár Fecskeová, Lívia - Salcher, Michaela M. - Piwosz, Kasia - Ghai, Rohit - Koblížek, Michal
Common Presence of Phototrophic Gemmatimonadota in Temperate Freshwater Lakes.
mSystems. Roč. 6, č. 2 (2021), č. článku e01241-20. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
R&D Projects: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA ČR(CZ) GJ20-23718Y; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Keywords : Gemmatimonadota * Gemmatimonadetes * anoxygenic phototrophs * aquatic bacteria * MAGs * metagenome * photosynthesis gene cluster * freshwater ecology * card-fish
OECD category: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impact factor: 7.328, year: 2021
Method of publishing: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.01241-20
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0323331 - 2.0539257 - BC 2021 RIV GB eng J - Journal Article
Mukherjee, Indranil - Salcher, Michaela M. - Andrei, Adrian-Stefan - Kavagutti, Vinicius Silva - Shabarova, Tatiana - Grujcic, V. - Haber, Markus - Layoun, Paul - Hodoki, Y. - Nakano, S. - Šimek, Karel - Ghai, Rohit
A freshwater radiation of diplonemids.
Environmental Microbiology. Roč. 22, č. 11 (2020), s. 4658-4668. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
R&D Projects: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA ČR(CZ) GA19-23469S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : multiple sequence alignment * microbial eukaryotes * marine * community * diversity
OECD category: Microbiology
Impact factor: 5.491, year: 2020
Method of publishing: Open access
https://doi.org/10.1111/1462-2920.15209
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316927File Download Size Commentary Version Access MUKHERJEE Environ Microbiol 2020.pdf 0 1 MB Author´s preprint open-access - 3.0539256 - BC 2021 RIV US eng J - Journal Article
Park, S.J. - Andrei, Adrian-Stefan - Bulzu, Paul-Adrian - Kavagutti, Vinicius Silva - Ghai, Rohit - Mosier, A.C.
Expanded diversity and metabolic versatility of marine nitrite-oxidizing bacteria revealed by cultivation- and genomics-based approaches.
Applied and Environmental Microbiology. Roč. 86, č. 22 (2020), s. 1-17, č. článku e01667-20. ISSN 0099-2240. E-ISSN 1098-5336
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : Nitrospina * Nitrospira * cultivation * marine sediment * metagenomics * nitrite oxidation
OECD category: Microbiology
Impact factor: 4.792, year: 2020
Method of publishing: Limited access
https://doi.org/10.1128/AEM.01667-20
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316926File Download Size Commentary Version Access Park ANDREI ApplEnvMicrobiol 2020.pdf 0 2.8 MB Author´s preprint require - 4.0538502 - BC 2021 RIV US eng J - Journal Article
Salcher, Michaela M. - Andrei, Adrian-Stefan - Bulzu, Paul-Adrian - Keresztes, Z.G. - Banciu, H.L. - Ghai, Rohit
Visualization of Lokiarchaeia and Heimdallarchaeia (Asgardarchaeota) by fluorescence in situ hybridization and catalyzed reporter deposition (CARD-FISH).
mSphere. Roč. 5, č. 4 (2020), s. 1-10, č. článku e00686-20. ISSN 2379-5042. E-ISSN 2379-5042
R&D Projects: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA ČR(CZ) GA19-23469S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : 16s ribosomal RNA * bacterioplankton populations * identification * archaea * abundant * Asgardarchaeota * Heimdallarchaeia * Lokiarchaeia * card-fish * morphology
OECD category: Microbiology
Impact factor: 4.389, year: 2020
Method of publishing: Open access
https://doi.org/10.1128/mSphere.00686-20
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316323File Download Size Commentary Version Access SALCHER mSphere 2020.pdf 1 1.4 MB Author´s preprint open-access - 5.0538424 - BC 2021 RIV US eng J - Journal Article
Inoue, K. - Tsunoda, S.P. - Singh, M. - Tomida, S. - Hososhima, S. - Konno, M. - Nakamura, R. - Watanabe, H. - Bulzu, P.A. - Banciu, H.L. - Andrei, Adrian-Stefan - Uchihashi, T. - Ghai, Rohit - Béja, O. - Kandori, H.
Schizorhodopsins: A family of rhodopsins from Asgard archaea that function as light-driven inward H+ pumps.
Science Advances. Roč. 6, č. 15 (2020), s. 1-12, č. článku eaaz2441. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : resonance raman * proton pump * bacteriorhodopsin * transport * viruses
OECD category: Microbiology
Impact factor: 14.143, year: 2020
Method of publishing: Open access
https://doi.org/10.1126/sciadv.aaz2441
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316223File Download Size Commentary Version Access Inoue ANDREI SciAdv.pdf 0 4.5 MB Author´s preprint open-access - 6.0510169 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
Kavagutti, Vinicius Silva - Andrei, Adrian-Stefan - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M. - Ghai, Rohit
Phage-centric ecological interactions in aquatic ecosystems revealed through ultra-deep metagenomics.
Microbiome. Roč. 7, č. 1 (2019), č. článku 135. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : FRESH-WATER ACTINOBACTERIA * RIBOSOMAL-RNA GENES * COMMUNITY COMPOSITIO
OECD category: Microbiology
Impact factor: 11.607, year: 2019
Method of publishing: Open access
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s40168-019-0752-0
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300830 - 7.0509916 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
Bulzu, P.A. - Andrei, Adrian-Stefan - Salcher, Michaela M. - Mehrshad, Maliheh - Inoue, K. - Kandori, H. - Béja, O. - Ghai, Rohit - Banciu, H.L.
Casting light on Asgardarchaeota metabolism in a sunlit microoxic niche.
Nature Microbiology. Roč. 4, č. 7 (2019), s. 1129-1137. ISSN 2058-5276. E-ISSN 2058-5276
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : multiple sequence alignment * archaea * origin * prediction * evolution
OECD category: Microbiology
Impact factor: 15.540, year: 2019
Method of publishing: Limited access
https://www.nature.com/articles/s41564-019-0404-y
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300521 - 8.0509914 - BC 2020 RIV CH eng J - Journal Article
Durán-Viseras, A. - Andrei, Adrian-Stefan - Ghai, Rohit - Sanchez-Porro, C. - Ventosa, A.
New Halonotius Species Provide Genomics-Based Insights Into Cobalamin Synthesis in Haloarchaea.
Frontiers in Microbiology. Roč. 10, AUG (2019), č. článku 1928. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : Halonotius * haloarchaea * comparative genomic analysis * hypersaline environment
OECD category: Microbiology
Impact factor: 4.236, year: 2019
Method of publishing: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2019.01928/full
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300507 - 9.0509912 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
Vavourakis, C. D. - Mehrshad, Maliheh - Balkema, C. - van Hall, R. - Andrei, Adrian-Stefan - Ghai, Rohit - Sorokin, D. Y. - Muyzer, G.
Metagenomes and metatranscriptomes shed new light on the microbial-mediated sulfur cycle in a Siberian soda lake.
BMC BIOLOGY. Roč. 17, č. 1 (2019), č. článku 69. E-ISSN 1741-7007
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) L200961651; AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů; Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : Soda lake * Haloalkaliphiles * Metagenomics * Metatranscriptomics * Thiosulfate
OECD category: Microbiology
Impact factor: 6.765, year: 2019
Method of publishing: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12915-019-0688-7
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300506 - 10.0504973 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
Andrei, Adrian-Stefan - Salcher, Michaela M. - Mehrshad, Maliheh - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Ghai, Rohit
Niche-directed evolution modulates genome architecture in freshwater Planctomycetes.
The ISME Journal. Roč. 13, č. 4 (2019), s. 1056-1071. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : multiple sequence alignment * bacterioplankton community * oxygenated hypolimnion
OECD category: Microbiology
Impact factor: 9.180, year: 2019
Method of publishing: Open access
https://www.nature.com/articles/s41396-018-0332-5.pdf
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0297231