Search results

  1. 1.
    0546949 - MBÚ 2022 RIV US eng J - Journal Article
    Mujakić, Izabela - Andrei, Adrian-Stefan - Shabarova, Tatiana - Kolesár Fecskeová, Lívia - Salcher, Michaela M. - Piwosz, Kasia - Ghai, Rohit - Koblížek, Michal
    Common Presence of Phototrophic Gemmatimonadota in Temperate Freshwater Lakes.
    mSystems. Roč. 6, č. 2 (2021), č. článku e01241-20. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA ČR(CZ) GJ20-23718Y; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
    Institutional support: RVO:61388971 ; RVO:60077344
    Keywords : Gemmatimonadota * Gemmatimonadetes * anoxygenic phototrophs * aquatic bacteria * MAGs * metagenome * photosynthesis gene cluster * freshwater ecology * card-fish
    OECD category: Microbiology; Microbiology (BC-A)
    Impact factor: 7.328, year: 2021
    Method of publishing: Open access
    https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.01241-20
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0323331
     
     
  2. 2.
    0539257 - BC 2021 RIV GB eng J - Journal Article
    Mukherjee, Indranil - Salcher, Michaela M. - Andrei, Adrian-Stefan - Kavagutti, Vinicius Silva - Shabarova, Tatiana - Grujcic, V. - Haber, Markus - Layoun, Paul - Hodoki, Y. - Nakano, S. - Šimek, Karel - Ghai, Rohit
    A freshwater radiation of diplonemids.
    Environmental Microbiology. Roč. 22, č. 11 (2020), s. 4658-4668. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA ČR(CZ) GA19-23469S
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : multiple sequence alignment * microbial eukaryotes * marine * community * diversity
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 5.491, year: 2020
    Method of publishing: Open access
    https://doi.org/10.1111/1462-2920.15209
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316927
    FileDownloadSizeCommentaryVersionAccess
    MUKHERJEE Environ Microbiol 2020.pdf01 MBAuthor´s preprintopen-access
     
     
  3. 3.
    0539256 - BC 2021 RIV US eng J - Journal Article
    Park, S.J. - Andrei, Adrian-Stefan - Bulzu, Paul-Adrian - Kavagutti, Vinicius Silva - Ghai, Rohit - Mosier, A.C.
    Expanded diversity and metabolic versatility of marine nitrite-oxidizing bacteria revealed by cultivation- and genomics-based approaches.
    Applied and Environmental Microbiology. Roč. 86, č. 22 (2020), s. 1-17, č. článku e01667-20. ISSN 0099-2240. E-ISSN 1098-5336
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : Nitrospina * Nitrospira * cultivation * marine sediment * metagenomics * nitrite oxidation
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 4.792, year: 2020
    Method of publishing: Limited access
    https://doi.org/10.1128/AEM.01667-20
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316926
    FileDownloadSizeCommentaryVersionAccess
    Park ANDREI ApplEnvMicrobiol 2020.pdf02.8 MBAuthor´s preprintrequire
     
     
  4. 4.
    0538502 - BC 2021 RIV US eng J - Journal Article
    Salcher, Michaela M. - Andrei, Adrian-Stefan - Bulzu, Paul-Adrian - Keresztes, Z.G. - Banciu, H.L. - Ghai, Rohit
    Visualization of Lokiarchaeia and Heimdallarchaeia (Asgardarchaeota) by fluorescence in situ hybridization and catalyzed reporter deposition (CARD-FISH).
    mSphere. Roč. 5, č. 4 (2020), s. 1-10, č. článku e00686-20. ISSN 2379-5042. E-ISSN 2379-5042
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA ČR(CZ) GA19-23469S
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : 16s ribosomal RNA * bacterioplankton populations * identification * archaea * abundant * Asgardarchaeota * Heimdallarchaeia * Lokiarchaeia * card-fish * morphology
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 4.389, year: 2020
    Method of publishing: Open access
    https://doi.org/10.1128/mSphere.00686-20
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316323
    FileDownloadSizeCommentaryVersionAccess
    SALCHER mSphere 2020.pdf11.4 MBAuthor´s preprintopen-access
     
     
  5. 5.
    0538424 - BC 2021 RIV US eng J - Journal Article
    Inoue, K. - Tsunoda, S.P. - Singh, M. - Tomida, S. - Hososhima, S. - Konno, M. - Nakamura, R. - Watanabe, H. - Bulzu, P.A. - Banciu, H.L. - Andrei, Adrian-Stefan - Uchihashi, T. - Ghai, Rohit - Béja, O. - Kandori, H.
    Schizorhodopsins: A family of rhodopsins from Asgard archaea that function as light-driven inward H+ pumps.
    Science Advances. Roč. 6, č. 15 (2020), s. 1-12, č. článku eaaz2441. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : resonance raman * proton pump * bacteriorhodopsin * transport * viruses
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 14.143, year: 2020
    Method of publishing: Open access
    https://doi.org/10.1126/sciadv.aaz2441
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316223
    FileDownloadSizeCommentaryVersionAccess
    Inoue ANDREI SciAdv.pdf04.5 MBAuthor´s preprintopen-access
     
     
  6. 6.
    0510169 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
    Kavagutti, Vinicius Silva - Andrei, Adrian-Stefan - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M. - Ghai, Rohit
    Phage-centric ecological interactions in aquatic ecosystems revealed through ultra-deep metagenomics.
    Microbiome. Roč. 7, č. 1 (2019), č. článku 135. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : FRESH-WATER ACTINOBACTERIA * RIBOSOMAL-RNA GENES * COMMUNITY COMPOSITIO
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 11.607, year: 2019
    Method of publishing: Open access
    https://microbiomejournal.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s40168-019-0752-0
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300830
     
     
  7. 7.
    0509916 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
    Bulzu, P.A. - Andrei, Adrian-Stefan - Salcher, Michaela M. - Mehrshad, Maliheh - Inoue, K. - Kandori, H. - Béja, O. - Ghai, Rohit - Banciu, H.L.
    Casting light on Asgardarchaeota metabolism in a sunlit microoxic niche.
    Nature Microbiology. Roč. 4, č. 7 (2019), s. 1129-1137. ISSN 2058-5276. E-ISSN 2058-5276
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : multiple sequence alignment * archaea * origin * prediction * evolution
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 15.540, year: 2019
    Method of publishing: Limited access
    https://www.nature.com/articles/s41564-019-0404-y
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300521
     
     
  8. 8.
    0509914 - BC 2020 RIV CH eng J - Journal Article
    Durán-Viseras, A. - Andrei, Adrian-Stefan - Ghai, Rohit - Sanchez-Porro, C. - Ventosa, A.
    New Halonotius Species Provide Genomics-Based Insights Into Cobalamin Synthesis in Haloarchaea.
    Frontiers in Microbiology. Roč. 10, AUG (2019), č. článku 1928. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : Halonotius * haloarchaea * comparative genomic analysis * hypersaline environment
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 4.236, year: 2019
    Method of publishing: Open access
    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2019.01928/full
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300507
     
     
  9. 9.
    0509912 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
    Vavourakis, C. D. - Mehrshad, Maliheh - Balkema, C. - van Hall, R. - Andrei, Adrian-Stefan - Ghai, Rohit - Sorokin, D. Y. - Muyzer, G.
    Metagenomes and metatranscriptomes shed new light on the microbial-mediated sulfur cycle in a Siberian soda lake.
    BMC BIOLOGY. Roč. 17, č. 1 (2019), č. článku 69. E-ISSN 1741-7007
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
    Grant - others:AV ČR(CZ) L200961651; AV ČR(CZ) MSM200961801
    Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů; Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : Soda lake * Haloalkaliphiles * Metagenomics * Metatranscriptomics * Thiosulfate
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 6.765, year: 2019
    Method of publishing: Open access
    https://bmcbiol.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12915-019-0688-7
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300506
     
     
  10. 10.
    0504973 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
    Andrei, Adrian-Stefan - Salcher, Michaela M. - Mehrshad, Maliheh - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Ghai, Rohit
    Niche-directed evolution modulates genome architecture in freshwater Planctomycetes.
    The ISME Journal. Roč. 13, č. 4 (2019), s. 1056-1071. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
    R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
    Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
    Institutional support: RVO:60077344
    Keywords : multiple sequence alignment * bacterioplankton community * oxygenated hypolimnion
    OECD category: Microbiology
    Impact factor: 9.180, year: 2019
    Method of publishing: Open access
    https://www.nature.com/articles/s41396-018-0332-5.pdf
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0297231
     
     


  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.