Search results
- 1.0504416 - ÚVGZ 2020 RIV CZ eng L4 - Software
Červený, Jan
Photobioreactor Control Scripts 1.0.
Internal code: DoAB_PBR-ControlScripts ; 2019
Technical parameters: Programatická realizace řídících skriptů využívá originálníh aplikčního rozhraní pro přístup k měřeným veličinám a akčním prvkům fotobioreaktorů a umožňuje tak implementaci algoritmů pro automatickou fenotypizaci a optimalizaci kultivovaných mikroorganismů a výzarné zefektivnění těchto procesů.
Economic parameters: Využitím těchto skriptů je dosaženo v průměru 60% zkrácení procesu detailní charakterizace a výzkumu kultivovaných mikroorganismů v porovnání s procesem kontrolovaným operátorem kultivace. Automatické zpracování dat pak dále přináši v průměru 75% navýšení objemu zpracovaných dat za časovou jednotku a umožnuje včasnou detekci nestabilit a nestandardních odezev zkoumaného biosystému v reálném čase. Vedle zkrácení kultivačního procesu a zefektivnění zpracování výstupních dat jsou zajištěny opakovatelnost a robustnost celého procesu. K dnešnímu dni bylo celosvětově prodáno více než 500 zařízení, u kterých je možné tyto skripty použít.
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Research Infrastructure: CzeCOS II - 90061
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : computational control * regulation * photobioreactor * microalgae * optimization * phenotypization * biotechnology * data acquisition * algorithms
OECD category: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
https://smartbiotech.github.io/PBR-ControlScripts/
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0296057 - 2.0503505 - ÚVGZ 2019 RIV CZ cze L4 - Software
Klem, Karel - Pokrývka, Filip
Software WPD 0.1 Weed Population Dynamics model – Software pro simulování populační dynamiky plevelů (počet vzešlých rostlin).
[Software WPD 0.1 Weed Population Dynamics model – Software for simulation of weed population dynamics (number of emerging plants).]
Internal code: WPD 0.1 ; 2018
Technical parameters: Jedná se o softwarový nástroj pro simulaci počtu vzešlých rostlin jednotlivých plevelných druhů na základě vstupních údajů o počáteční vertikální distribuci semen v půdě, technologii zpracování půdy a teplotě půdy nebo termínu výsevu plodiny. Software funguje jako webová aplikace a je tvořen několika dílčími algoritmy, které na sebe navazují a jsou naprogramovány v jazyce PHP.
Economic parameters: Software provádí simulaci vlivu zpracování půdy na vzcházení plevelných druhů. To umožňuje uživateli navrhnout nejvhodnější strategii regulace plevelů zahrnující nejen přímé metody ochrany ale také nepřímé metody, jako je právě technologie zpracování půdy. Přínosy v úspoře nákladů na regulaci plevelů jsou odhadovány ve výši 10-20%. Vedle toho lze očekávat také snížení zátěže životního prostředí rezidui herbicidů.
R&D Projects: GA MZe QJ1530373; GA MŠMT(CZ) LO1415
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : weed population dynamics * soil cultivation * temperature * dormancy * number of emerging plants
OECD category: Agronomy, plant breeding and plant protection
https://alpha.czechglobe.cz/wpd/
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0295316 - 3.0499638 - ÚVGZ 2019 RIV CZ eng L4 - Software
Šigut, Ladislav - Mauder, M. - Sedlák, Pavel - Wutzler, T. - Fischer, Milan - Macálková, Lenka - McGloin, Ryan - Fratini, G.
Openeddy 0.0.0.9004 - The R Package for Low Frequency Eddy Covariance Data Processing.
Internal code: openeddy 0.0.0.9004 ; 2018
Technical parameters: Tento balíček poskytuje funkce pro základní manipulaci s eddy kovariančními daty, kontrolu jejich kvality (schéma kontroly podobné Mauder et al., 2013), zpracování, sumarizaci a zobrazování tohoto typu dat. Cílem softwaru je standardizace a automatizace kontroly kvality a zajištění reprodukovatelnosti zpracování dat. Software podléhá licenci GPL >= 2 (Všeobecná veřejná licence GNU, verze 2 a vyšší).
Economic parameters: Zpracování eddy kovariančních dat je časově náročné a vyžaduje expertní mezioborové znalosti. Formalizace výpočetních úkonů v podobě softwaru výrazně šetří čas potřebný ke zpracování dat a přináší tak úsporu v oblasti lidských zdrojů.
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LO1415
Research Infrastructure: CzeCOS II - 90061
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : eddy covariance data * sotware
OECD category: Meteorology and atmospheric sciences
https://github.com/lsigut/openeddy
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0291968 - 4.0484793 - ÚVGZ 2019 RIV CZ cze L4 - Software
Klem, Karel - Pokrývka, Filip
GaeumaCast - Software pro předpověď napadení ozimé pšenice černáním pat stébel (černání kořenů a báze stébel, původce Gaeumannomyces graminis).
[GaeumaCast - Software for prediction of winter wheat infestation by take-all (caused by Gaeumannomyces graminis).]
Internal code: GaeumaCast 1.01 ; 2017
Technical parameters: Software GaeumaCast představuje predikční model založený na neuronové síti, který umožňuje aktuální předpověď napadení černáním pat stébel v daném roce na základě údajů o průběhu počasí. Současně s použitím klimatických modelů je možné model využít pro odhad budoucích trendů vývoje napadení v souvislostí se změnou klimatu a při použití různých scénářů změny klimatu. Algoritmus neuronové sítě byl převeden do kódu C++ a následně využit pro vytvoření webové aplikace v jazyce PHP. Aplikace obsahuje stránku s licenčními ujednáními a stránku pro vkládání vstupních a generování výstupních dat. Vstupní data mohou být zadávána manuálně nebo ve formě vstupní tabulky. Výstupem je predikovaná hodnota indexu napadení zobrazená přímo na stránce nebo ve formě výstupní tabulky.
Economic parameters: Možnost vyhodnocení dlouhodobých trendů ve vývoji napadení. Možnost plánování strategie ochrany (moření, osevní postup, šlechtění).
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA MZe QJ1530373
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : take-all * Gaeumannomyces graminis * winter wheat * prediction model * neural network
OECD category: Agronomy, plant breeding and plant protection
https://alpha.czechglobe.cz/gaeumacast/
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0279935 - 5.0484791 - ÚVGZ 2019 RIV CZ cze L4 - Software
Klem, Karel - Pokrývka, Filip
OculimaCast - Software pro předpověď napadení ozimé pšenice pravým stéblolamem (původci Oculimacula yallundae a Oculimacula acuformis).
[OculimaCast - Software for prediction of winter wheat infestation by eyespot (Oculimacula yallundae and Oculimacula acuformis).]
Internal code: OculimaCast 1.01 ; 2017
Technical parameters: Software OculimaCast představuje predikční model založený na neuronové síti, který umožňuje aktuální předpověď napadení pravým stéblolamem v daném roce a na základě této predikce pak přizpůsobení ochrany proti pravému stéblolamu. Současně s použitím klimatických modelů je možné model využít pro odhad budoucích trendů vývoje napadení v souvislostí se změnou klimatu a při použití různých scénářů změny klimatu. Algoritmus neuronové sítě byl převeden do kódu C++ a následně využit pro vytvoření webové aplikace v jazyce PHP. Aplikace obsahuje stránku s licenčními ujednáními a stránku pro vkládání vstupních a generování výstupních dat. Vstupní data mohou být zadávána manuálně nebo ve formě vstupní tabulky. Výstupem je predikovaná hodnota indexu napadení zobrazená přímo na stránce nebo ve formě výstupní tabulky.
Economic parameters: Snížení nákladů na ochranu proti pravému stéblolamu. Snížení škod způsobených pravým stéblolamem díky cíleným aplikacím. Snížení zatížení životního prostředí pesticidy. Využití pro tvorbu dlouhodobé strategie šlechtění a ochrany rostlin v souvislosti se změnou klimatu
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA MZe QJ1530373
Research Infrastructure: CzeCOS II - 90061
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : eyespot * Oculimacula * winter wheat * prediction model * neural network
OECD category: Agronomy, plant breeding and plant protection
https://alpha.czechglobe.cz/oculimacast/
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0279933 - 6.0484194 - ÚVGZ 2019 RIV CZ cze L4 - Software
Klem, Karel - Pokrývka, Filip
NitroSpec - software pro vyhodnocení stavu výživy jarního ječmene dusíkem s využitím hyperspektrálních dat.
[NitroSpec-software for estimation of nitrogen status in spring barely using hyperspectral data.]
Internal code: NitroSens 1.01 ; 2017
Technical parameters: Jedná se o softwarový nástroj pro vyhodnocení stavu výživy jarního ječmene dusíkem s založený na neuronové síti. Algoritmus neuronové sítě byl převeden do kódu C++ a následně využit pro vytvoření webové aplikace která je vytvořena v jazyce PHP. Aplikace obsahuje stránku s licenčními ujednáními a stránku pro vkládání vstupních a generování výstupních dat. Vstupní data mohou být zadávána manuálně nebo ve formě vstupní tabulky. Výstupem je tabulka s vypočtenými parametry stavu výživy dusíkem
Economic parameters: Software umožňuje zpřesnění výživy ječmene dle skutečné potřeby a tím snížení nákladů na výživu dusíkem, zvýšení výnosů a omezení zátěže životního prostředí.
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA TA ČR TH02030248
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : spectral reflectance * spring barley * nitrogen * plant nutrition * neural networks
OECD category: Agricultural biotechnology and food biotechnology
https://alpha.czechglobe.cz/nitrospec/
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0279331 - 7.0446499 - ÚVGZ 2016 RIV CZ ger L4 - Software
Doležal, Jan Daniel - Dvorská, Alice - Hanuš, Vlastimil - Komínková, Kateřina
Informační systém pro výzkumnou infrastrukturu.
[Information System for Research Infrastructure.]
Internal code: IS RI 1501 ; 2015
Technical parameters: Požadavky na produkční nasazení jsou: OS Centos 6.5 Linux nebo novější, server Apache 2.2.15, PHP 5.3.3 jako modul Apache s podporou MySQL PDO driverů, ZIPu, databáze MySQL 5.1 nebo kompatibilní MariaDB s podporou InnoDB tabulek. Systém byl testován na nejnovějších Chrome a Mozilla Firefox prohlížečích, základní funkčnost byla ověřena i pro Internet Explorer. Jan Daniel Doležal (IČ 01679341) poskytuje CVGZ AV ČR výhradní a rozsahem a způsobem užití neomezenou licenci k veškerým plněním uživatele (IT složku tvorby softwaru) na základě smlouvy ze dne 30.4.2015, která jsou chráněna právem autorským.Odpovědná osoba za jednání: Alice Dvorská, dvorska.a@czechglobe.cz, CVGZ AV ČR, Bělidla 4a, 603 00 Brno, tel.: 511 192 297
Economic parameters: Efektivní management měření a technického a personálního provozu výzkumných infrastruktur v oblasti výzkumu změn klimatu
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LO1415
Institutional support: RVO:67179843
Keywords : information system * research infrastructure * data management
Subject RIV: DG - Athmosphere Sciences, Meteorology
https://kresin.jtl.cz
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0248480