0604416 - ÚVGZ 2025 RIV CZ eng L4 - Software
Zavřel, TomášCyanoTools 1.0: Advanced Data Analysis Tools for Microalgae Research.
Internal code: CyanoTools ; 2024
Technical parameters: K realizaci byl využit programovací jazyk Python a jeho nadstavba Flask. Webové rozhraní využívá HTML, CSS s Java Script. Zdrojová data jsou očekávána ve výstupním standardu přístrojů firmy PSI, Walz, Jasco a dalších Konkrétně jsou podporovány vstupy ve formátech .csv, .txt a obrazové formáty .png, .jpg, .jpeg, .tif, .tiff, .bmp a .gif. Výstupy jsou buď obrazové formáty, nebo .xlsx soubory. Technická dokumentace výsledku je k dispozici na adrese: https://github.com/Zastupic/tools-py.e-cyanoba cterium.org.
Economic parameters: Nástroj umožňuje provádět analýzu pigmentových profilů, počtu a velikosti buněk mikrořas z mikroskopických fotek. Dále umožňuje v režimu vyšší průchodnosti zpracovat data z fluorescenčního spektrofluorometru a kinetických fluorometrů, čímž umožňuje v průměru 80% zkrácení časových nároků na datovou analýzu. K dnešnímu dni bylo celosvětově prodáno více než 2000 zařízení AquaPen / FluorPen, 500 zařízení Multi-Color PAM / Dual PAM a nespočet mikroskopů, na jejichž datové výstupy lze nástroj použít.ových nároků na datovou analýzu. K dnešnímu dni bylo celosvětově prodáno více než 2000 zařízení AquaPen / FluorPen, 500 zařízení Multi-Color PAM / Dual PAM a nespočet mikroskopů, na jejichž datové výstupy lze nástroj použít.
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LUAUS24149
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : pam fluorometry * microscopy * fluorescence spectroscopy * calculators * microalgae * biotechnology * data science * algorithms * tidy data
OECD category: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Result website:
https://tools-py.e-cyanobacterium.org/
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0361814