Search results

  1. 1.
    0524315 - ÚVGZ 2021 RIV CZ eng L4 - Software
    Červený, Jan
    Web Tool for Photobioreactor Data Analysis 1.0.
    Internal code: DoAB_PBR-DataAnalysis ; 2020
    Technical parameters: Programatická realizace pokročilé analýzy vědeckých dat generovaných mikrořasovými kultivártory. K realizaci nástroje byl využit statistický programovací jazyk R a jeho nadstavba pro tvorbu interaktivních webových nástrojů Shiny. Zdrojová data pro analýzu jsou primárně očekávána ve výstupním standardu přístrojů firmy Photon Systems Instruments, s. r. o. Dále jsou podporovány vstupy v tabulkových formátech .csv a .xlsx.
    Economic parameters: Využitím tohoto nástroje je dosaženo v průměru 70% zkrácení procesu zpracování a analýzy dat generovaných výkonnými mikrořasovými kultivátory. Automatizace analýzy a použitých přístupů dále spolu s gereováním standardizovaných výstupů zajišťuje efektivnější reporting a přípravu dat pro další stupeň analýzy dat, což vede v průměru k 80% zkrácení časových nároků na analýzu kultivačních dat. K dnešnímu dni bylo celosvětově prodáno více než 500 zařízení, na jejich datové výstupy lze nástroj použít.
    R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TN01000048
    Institutional support: RVO:86652079
    Keywords : photobioreactor * microalgae * characterization * phenotypization * biotechnology * data science * algorithms * tidy data
    Subject RIV: EF - Botanics
    OBOR OECD: Plant sciences, botany
    https://czechglobe-doab.shinyapps.io/PBR-DataAnalysis/
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0308681
     
     
  2. 2.
    0504416 - ÚVGZ 2020 RIV CZ eng L4 - Software
    Červený, Jan
    Photobioreactor Control Scripts 1.0.
    Internal code: DoAB_PBR-ControlScripts ; 2019
    Technical parameters: Programatická realizace řídících skriptů využívá originálníh aplikčního rozhraní pro přístup k měřeným veličinám a akčním prvkům fotobioreaktorů a umožňuje tak implementaci algoritmů pro automatickou fenotypizaci a optimalizaci kultivovaných mikroorganismů a výzarné zefektivnění těchto procesů.
    Economic parameters: Využitím těchto skriptů je dosaženo v průměru 60% zkrácení procesu detailní charakterizace a výzkumu kultivovaných mikroorganismů v porovnání s procesem kontrolovaným operátorem kultivace. Automatické zpracování dat pak dále přináši v průměru 75% navýšení objemu zpracovaných dat za časovou jednotku a umožnuje včasnou detekci nestabilit a nestandardních odezev zkoumaného biosystému v reálném čase. Vedle zkrácení kultivačního procesu a zefektivnění zpracování výstupních dat jsou zajištěny opakovatelnost a robustnost celého procesu. K dnešnímu dni bylo celosvětově prodáno více než 500 zařízení, u kterých je možné tyto skripty použít.
    R&D Projects: GA MŠk(CZ) LO1415; GA MŠk(CZ) LM2015055; GA MŠk(CZ) EF16_026/0008413
    Research Infrastructure: CzeCOS II - 90061
    Institutional support: RVO:86652079
    Keywords : computational control * regulation * photobioreactor * microalgae * optimization * phenotypization * biotechnology * data acquisition * algorithms
    Subject RIV: EA - Cell Biology
    OBOR OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
    https://smartbiotech.github.io/PBR-ControlScripts/
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0296057