Search results
- 1.0583805 - BC 2024 RIV GB eng J - Journal Article
Kavagutti, Vinicius Silva - Bulzu, Paul-Adrian - Chiriac, Maria-Cecilia - Salcher, Michaela M. - Mukherjee, Indranil - Shabarova, Tatiana - Grujčič, Vesna - Mehrshad, Maliheh - Kasalický, Vojtěch - Andrei, A.S. - Jezberová, Jitka - Seďa, Jaromír - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Šimek, Karel - Ghai, Rohit
High-resolution metagenomic reconstruction of the freshwater spring bloom.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 15. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
R&D Projects: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR GA22-03662S; GA ČR(CZ) GA19-23261S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : bacterioplankton populations * seasonal succession * giant virus * chrysochromulina
OECD category: Microbiology
Impact factor: 15.5, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-022-01451-4
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0351803 - 2.0538633 - BC 2021 RIV GB eng J - Journal Article
Šimek, Karel - Grujčič, Vesna - Mukherjee, Indranil - Kasalický, Vojtěch - Nedoma, Jiří - Posch, T. - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M.
Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 96, č. 10 (2020), č. článku fiaa121. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : ciliates * bacterivorous and predatory flagellates * Cercozoa * Cryptophyceae * freshwater microbial food webs * Katablepharidacea
OECD category: Ecology
Impact factor: 4.194, year: 2020
Method of publishing: Open access
https://doi.org/10.1093/femsec/fiaa121
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0316400File Download Size Commentary Version Access SIMEK FEMS Microbiol Ecol 2020.pdf 0 3.9 MB Author´s preprint open-access - 3.0510169 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
Kavagutti, Vinicius Silva - Andrei, Adrian-Stefan - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M. - Ghai, Rohit
Phage-centric ecological interactions in aquatic ecosystems revealed through ultra-deep metagenomics.
Microbiome. Roč. 7, č. 1 (2019), č. článku 135. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : FRESH-WATER ACTINOBACTERIA * RIBOSOMAL-RNA GENES * COMMUNITY COMPOSITIO
OECD category: Microbiology
Impact factor: 11.607, year: 2019
Method of publishing: Open access
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s40168-019-0752-0
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300830 - 4.0509916 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
Bulzu, P.A. - Andrei, Adrian-Stefan - Salcher, Michaela M. - Mehrshad, Maliheh - Inoue, K. - Kandori, H. - Béja, O. - Ghai, Rohit - Banciu, H.L.
Casting light on Asgardarchaeota metabolism in a sunlit microoxic niche.
Nature Microbiology. Roč. 4, č. 7 (2019), s. 1129-1137. ISSN 2058-5276. E-ISSN 2058-5276
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : multiple sequence alignment * archaea * origin * prediction * evolution
OECD category: Microbiology
Impact factor: 15.540, year: 2019
Method of publishing: Limited access
https://www.nature.com/articles/s41564-019-0404-y
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300521 - 5.0509912 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
Vavourakis, C. D. - Mehrshad, Maliheh - Balkema, C. - van Hall, R. - Andrei, Adrian-Stefan - Ghai, Rohit - Sorokin, D. Y. - Muyzer, G.
Metagenomes and metatranscriptomes shed new light on the microbial-mediated sulfur cycle in a Siberian soda lake.
BMC BIOLOGY. Roč. 17, č. 1 (2019), č. článku 69. E-ISSN 1741-7007
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) L200961651; AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů; Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : Soda lake * Haloalkaliphiles * Metagenomics * Metatranscriptomics * Thiosulfate
OECD category: Microbiology
Impact factor: 6.765, year: 2019
Method of publishing: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12915-019-0688-7
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0300506 - 6.0504973 - BC 2020 RIV GB eng J - Journal Article
Andrei, Adrian-Stefan - Salcher, Michaela M. - Mehrshad, Maliheh - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Ghai, Rohit
Niche-directed evolution modulates genome architecture in freshwater Planctomycetes.
The ISME Journal. Roč. 13, č. 4 (2019), s. 1056-1071. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : multiple sequence alignment * bacterioplankton community * oxygenated hypolimnion
OECD category: Microbiology
Impact factor: 9.180, year: 2019
Method of publishing: Open access
https://www.nature.com/articles/s41396-018-0332-5.pdf
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0297231 - 7.0495167 - BC 2019 RIV GB eng J - Journal Article
Vavourakis, C. D. - Andrei, Adrian-Stefan - Mehrshad, Maliheh - Ghai, Rohit - Sorokin, D. Y. - Muyzer, G.
A metagenomics roadmap to the uncultured genome diversity in hypersaline soda lake sediments.
Microbiome. Roč. 6, SEP (2018), č. článku 168. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
R&D Projects: GA ČR GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : soda lake sediments * metagenomics * Haloalkaliphilic extremophiles * Candidate Phyla Radiation
OECD category: Microbiology
Impact factor: 10.465, year: 2018
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0288293 - 8.0495155 - BC 2019 RIV GB eng J - Journal Article
Mehrshad, Maliheh - Rodriguez-Valera, F. - Amoozegar, M.A. - López-García, P. - Ghai, Rohit
The enigmatic SAR202 cluster up close: shedding light on a globally distributed dark ocean lineage involved in sulfur cycling.
The ISME Journal. Roč. 12, č. 3 (2018), s. 655-668. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : sulfate-reducing prokaryotes * nitrite-oxidizing bacterium * ribosomal-rna genes * phylum chloroflexi
OECD category: Microbiology
Impact factor: 9.493, year: 2018
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0288295 - 9.0495144 - BC 2019 RIV GB eng J - Journal Article
Mehrshad, Maliheh - Salcher, M.M. - Okazaki, Y. - Nakano, S. - Šimek, Karel - Andrei, Adrian-Stefan - Ghai, Rohit
Hidden in plain sight-highly abundant and diverse planktonic freshwater Chloroflexi.
Microbiome. Roč. 6, OCT (2018), č. článku 176. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
R&D Projects: GA ČR GA17-04828S; GA ČR(CZ) GA13-00243S
Grant - others:AV ČR(CZ) JSPS-17-17; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Bilaterální spolupráce; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : Chloroflexi * freshwater ecology * metagenomics * CARD-FISH
OECD category: Microbiology
Impact factor: 10.465, year: 2018
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0288294 - 10.0481807 - BC 2018 RIV CH eng J - Journal Article
Cabello-Yeves, P.J. - Ghai, Rohit - Mehrshad, Maliheh - Picazo, A. - Camacho, A. - Rodriguez-Valera, F.
Reconstruction of diverse verrucomicrobial genomes from metagenome datasets of freshwater reservoirs.
Frontiers in Microbiology. Roč. 8, Nov (2017), č. článku 2131. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
R&D Projects: GA ČR GA17-04828S
Grant - others:AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : freshwater Verrucomicrobia * metagenomics * rhodopsin * nitrogen fixation * genome streamlining
OECD category: Microbiology
Impact factor: 4.019, year: 2017
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0277284