Search results
- 1.0422267 - ÚEB 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kopecký, David - Martis, M. - Čihalíková, Jarmila - Hřibová, Eva - Vrána, Jan - Bartoš, Jan - Kopecká, Jitka - Cattonaro, F. - Stočes, Štěpán - Novák, Petr - Neumann, Pavel - Macas, Jiří - Šimková, Hana - Studer, B. - Asp, T. - Baird, J. H. - Navrátil, Petr - Karafiátová, Miroslava - Kubaláková, Marie - Šafář, Jan - Mayer, K. - Doležel, Jaroslav
Flow Sorting and Sequencing Meadow Fescue Chromosome 4F.
Plant Physiology. Roč. 163, č. 3 (2013), s. 1323-1337. ISSN 0032-0889. E-ISSN 1532-2548
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP501/11/0504; GA MŠMT(CZ) OC10037
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) ED0007/01/01
Program: ED
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:60077344
Klíčová slova: SATELLITE DNA-SEQUENCES * FESTUCA-PRATENSIS * LOLIUM-MULTIFLORUM
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 7.394, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0228467Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2013_Kopecky_PLANT PHYSIOLOGY_1323.pdf 10 2.1 MB Jiná povolen - 2.0392350 - BC 2014 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, Petr - Neumann, Pavel - Pech, Jiří - Steinhaisl, J. - Macas, Jiří
RepeatExplorer: a Galaxy-based web server for genome-wide characterization of eukaryotic repetitive elements from next-generation sequence reads.
Bioinformatics. Roč. 29, č. 6 (2013), s. 792-793. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1460-2059
Grant CEP: GA ČR GBP501/12/G090; GA MŠMT(CZ) OC10037
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: repetitiveDNA * computational analysis * next generation sequencing
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 4.621, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0221235 - 3.0381552 - BFÚ 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Renny-Byfield, S. - Kovařík, Aleš - Chester, M. - Nichols, R.A. - Macas, Jiří - Novák, Petr - Leitch, A.R.
Independent, rapid and targeted loss of highly repetitive DNA in natural and synthetic allopolyploids of Nicotiana tabacum.
PLoS ONE. Roč. 7, č. 5 (2012), e36963. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP501/10/0208; GA MŠMT OC10037
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040702; CEZ:AV0Z50510513
Klíčová slova: chromosome evolution * repetitive DNA * allopolyploid
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika; EB - Genetika a molekulární biologie (BC-A)
Impakt faktor: 3.730, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0211996 - 4.0381546 - BC 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Martis, M.M. - Klemme, S. - Banaei-Moghaddam, A.M. - Blattner, F.R. - Macas, Jiří - Schmutzer, T. - Scholz, U. - Gundlach, H. - Wicker, T. - Šimková, Hana - Novák, Petr - Neumann, Pavel - Kubaláková, Marie - Bauer, E. - Haseneyer, G. - Fuchs, J. - Doležel, Jaroslav - Stein, N. - Mayer, K.F.X. - Houben, A.
Selfish supernumerary chromosome reveals its origin as a mosaic of host genome and organellar sequences.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 109, č. 33 (2012), s. 13343-13346. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR GBP501/12/G090; GA MŠMT(CZ) OC10037
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50510513
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61389030
Klíčová slova: FULL-LENGTH CDNAS * SECALE-CEREALE L. * B-CHROMOSOMES * REPETITIVE SEQUENCES
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie; EB - Genetika a molekulární biologie (UEB-Q)
Impakt faktor: 9.737, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0215623Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0381546_Martis.pdf 9 434.9 KB Jiná povolen - 5.0370331 - BFÚ 2012 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Renny-Byfield, S. - Chester, M. - Kovařík, Aleš - Le Comber, S.C. - Grandbastien, M.-A. - Deloger, M. - Nichols, R.A. - Macas, Jiří - Novák, Petr - Chase, M.W. - Leitch, A.R.
Next generation sequencing reveals genome downsizing in allotetraploid Nicotiana tabacum, predominantly through the elimination of paternally derived repetitive DNAs.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 28, č. 10 (2011), s. 2843-2854. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) OC10037
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702; CEZ:AV0Z50510513
Klíčová slova: allopolyploidy * evolution * genome structure
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.550, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0204166 - 6.0367358 - BC 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Macas, Jiří - Kejnovský, Eduard - Neumann, Pavel - Novák, Petr - Koblížková, Andrea - Vyskot, Boris
Next Generation Sequencing-Based Analysis of Repetitive DNA in the Model Dioceous Plant Silene latifolia.
PLoS ONE. Roč. 6, č. 11 (2011), e27335. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) OC10037; GA MŠMT(CZ) LC06004; GA MŠMT(CZ) LH11058; GA ČR(CZ) GAP501/10/0102; GA ČR(CZ) GAP305/10/0930
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50510513; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: Plant genome * Sequencing-Based Analyses * Repetitive DNA * Silene latifolia
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 4.092, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0202067 - 7.0348727 - BC 2011 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Macas, Jiří - Neumann, Pavel - Novák, Petr - Jiang, J.
Global sequence characterization of rice centromeric satellite based on oligomer frequency analysis in large-scale sequencing data.
Bioinformatics. Roč. 26, č. 1797 (2010), s. 2101-2108. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1460-2059
Grant CEP: GA AV ČR KJB500960802; GA MŠMT(CZ) OC10037; GA MŠMT(CZ) LC06004
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50510513
Klíčová slova: next-generation sequencing * satellite repeats * K-mer analysis
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 4.877, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0189169 - 8.0347465 - BC 2011 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, Petr - Neumann, Pavel - Macas, Jiří
Graph-based clustering and characterization of repetitive sequences in next-generation sequencing data.
BMC Bioinformatics. Roč. 11, č. 1 (2010), s. 378-389. ISSN 1471-2105. E-ISSN 1471-2105
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) OC10037; GA MŠMT(CZ) LC06004
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50510513
Klíčová slova: repetitive DNA * plant genome * next generation sequencing
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 3.028, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0188237