Search results
- 1.0584477 - ÚBO 2024 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Šindelka, Radek - Mendel, Jan
Diagnostická souprava RT-qPCR ICHTident na detekci a kvantifikaci Ichthyophthirius multifiliis ve vzorcích vody, tkání a kožních stěrů.
[Diagnostic set RT-qPCR ICHTident for detection and quantification of Ichthyopthirius multifiliis in water, tissue and skin samples.]
Internal code: 18/2023 ; 2023
Technical parameters: Zařazeno do portfolia služeb Centra aplikované zoologie ÚBO a již nabízeno veřejnosti.
Economic parameters: Současná úroveň produkce lososovitých ryb pokrývá přibližně 50 % celkové spotřeby v ČR. V dalším období se předpokládá nárůst až o 500 tun ročně. Nová diagnostická souprava by se mohla podílet až na 10 % tohoto nárůstu. Včasné nastavení léčebných a preventivních opatření v případě ohrožení i celková optimalizace podmínek chovu lososovitých ryb v RAS (zvýšení přežití, snížení nákladů na chov atd.) by měla pozitivně ovlivnit výši ztrát v průběhu produkčního cyklu na úrovni minimálně 10–20 %. Zvýšení produkce prostřednictvím snížení ztrát, způsobených různými původci a pohybujících se v průběhu celého produkčního cyklu na úrovni 30–50 %, třeba i o 1 %, přinese při realizační ceně 100 Kč za 1 kg tržních ryb vyšší tržby o 50–60 tis. Kč.
R&D Projects: GA MZe(CZ) QK21010030
Institutional support: RVO:68081766 ; RVO:86652036
Keywords : quantitative PCR * detection * Ichthyopthirius
OECD category: Fishery; Fishery (BTO-N)
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0352410 - 2.0570435 - ÚŽFG 2023 RIV GB eng J - Journal Article
Dziedzinská, Radka - Okunková, J. - Králík, Petr - Svobodová, J. - Malá, M. - Slaná, I.
Identification of and discrimination between the Mycobacterium abscessus complex and Mycobacterium avium complex directly from sputum using quadruplex real-time PCR.
Journal of Medical Microbiology. Roč. 71, č. 12 (2022), č. článku 001611. ISSN 0022-2615. E-ISSN 1473-5644
Institutional support: RVO:67985904
Keywords : cystic fibrosis * mycobacteria * quadruplex quantitative PCR
OECD category: Microbiology
Impact factor: 3, year: 2022
Method of publishing: Limited access
https://asep.lib.cas.cz/arl-cav/cs/csg/?repo=crepo1&key=96384141342
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0341731 - 3.0569685 - BTÚ 2023 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Šindelka, Radek - Mendel, Jan
DIAGNOSTICKÁ SOUPRAVA RT-qPCR AEROMident na detekci a kvantifikaci Aeromonas spp. ve vzorcích vody, tkání a kožních stěrů.
[DIAGNOSTIC SET RT-qPCR AEROMident for detection and quantification of Aeromonas spp. in water, tissue and skin samples.]
Internal code: 16/22 ; 2022
Technical parameters: Prototyp + funkční vzorek
Economic parameters: zatím žádné
R&D Projects: GA MZe(CZ) QK21010030
Institutional support: RVO:86652036 ; RVO:68081766
Keywords : quantitative PCR * detection * Aeromonas
OECD category: Fishery
https://www.ibt.cas.cz/export/sites/btu/.content/files/vyzkum/06-laborator-genove-exprese/Funkcni-vzorek_16_2022.pdf
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0341058 - 4.0569684 - BTÚ 2023 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Šindelka, Radek - Mendel, Jan
DIAGNOSTICKÁ SOUPRAVA RT-qPCR FLAVident na detekci a kvantifikaci Flavobacterium psychrophilum ve vzorcích vody, tkání a kožních stěrů.
[DIAGNOSTIC SET RT-qPCR FLAVidentfor for detection and quantification of Flavobacterium psychrophilum in water, tissue and skin samples.]
Internal code: 15/22 ; 2022
Technical parameters: Prototyp + funkční vzorek
Economic parameters: zatím žádné
R&D Projects: GA MZe(CZ) QK21010030
Institutional support: RVO:86652036 ; RVO:68081766
Keywords : quantitative PCR * detection * Flavobacterium
OECD category: Fishery
https://www.ibt.cas.cz/export/sites/btu/.content/files/vyzkum/06-laborator-genove-exprese/Funkcni-vzorek_15_2022.pdf
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0341057 - 5.0569681 - BTÚ 2023 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Šindelka, Radek - Mendel, Jan
DIAGNOSTICKÁ SOUPRAVA RT-qPCR TETRACAPSident na detekci a kvantifikaci Tetracapsuloides bryosalmonae ve vzorcích vody, tkání a kožních stěrů.
[DIAGNOSTIC SET RT-qPCR TETRACAPSident for detection and quantification of Tetracapsuloides bryosalmonae in water, tissue and skin samples.]
Internal code: 17/22 ; 2022
Technical parameters: Prototyp + funkční vzorek
Economic parameters: zatím žádné
R&D Projects: GA MZe(CZ) QK21010030
Institutional support: RVO:86652036 ; RVO:68081766
Keywords : quantitative PCR * detection * Tetracapsuloides
OECD category: Fishery
https://www.ibt.cas.cz/export/sites/btu/.content/files/vyzkum/06-laborator-genove-exprese/Funkcni-vzorek_17_2022.pdf
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0341056 - 6.0565966 - BC 2023 RIV AU eng J - Journal Article
Kyslík, Jiří - Vancová, Marie - Bartošová-Sojková, Pavla - Lövy, Alena - Holzer, Astrid S. - Fiala, Ivan
Expression profiling and cellular localization of myxozoan minicollagens during nematocyst formation and sporogenesis.
International Journal for Parasitology. Roč. 52, č. 10 (2022), s. 667-675. ISSN 0020-7519. E-ISSN 1879-0135
R&D Projects: GA ČR(CZ) GX19-28399X; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : Cnidaria * Myxozoa * Parasite * Ncol-5 * Nematocyst * Quantitative PCR * Immunolabelling
OECD category: Cell biology
Impact factor: 4, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0020751922001047?via%3Dihub
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0339405 - 7.0556873 - ÚŽFG 2023 RIV GB eng J - Journal Article
Čechová, M. - Beinhauerová, M. - Babák, V. - Králík, Petr
A viability assay combining palladium compound treatment with quantitative PCR to detect viable Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis cells.
Scientific Reports. Roč. 12, č. 1 (2022), č. článku 4769. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Institutional support: RVO:67985904
Keywords : Mycobacterium avium * quantitative PCR
OECD category: Biochemistry and molecular biology
Impact factor: 4.6, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-022-08634-x
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0331461 - 8.0552459 - BC 2022 RIV GB eng J - Journal Article
Sagová-Marečková, M. - Boenigk, J. - Bouchez, A. - Cermakova, K. - Chonova, T. - Cordier, T. - Eisendle, U. - Elersek, T. - Fazi, S. - Fleituch, T. - Frühe, L. - Gajdosova, M. - Graupner, N. - Haegerbaeumer, A. - Kelly, A.-M. - Kopecký, J. - Leese, F. - Nõges, P. - Orlic, S. - Panksep, K. - Pawlowski, J. - Petrusek, A. - Piggott, J.J. - Rusch, J.C. - Salis, R. - Schenk, J. - Šimek, Karel - Šťovíček, A. - Strand, D.A. - Vasquez, M.I. - Vralstad, T. - Zlatkovic, S. - Zupancic, M. - Stoeck, T.
Expanding ecological assessment by integrating microorganisms into routine freshwater biomonitoring.
Water Research. Roč. 191, 1 March 2021 (2021), č. článku 116767. ISSN 0043-1354. E-ISSN 1879-2448
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : sulfate-reducing bacteria * microbial community composition * antibiotic-resistance genes * waste-water * nitrogen-fixation * quantitative pcr * biotic integrity * next-generation * phytoplankton composition * cyanobacterial community
OECD category: Microbiology
Impact factor: 13.400, year: 2021
Method of publishing: Open access
https://doi.org/10.1016/j.watres.2020.116767
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0327583 - 9.0534593 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Cahová, M. - Dráber, M. - Dráber, Petr
R-qPCR-PNPLA3 Kit, prototyp soupravy pro kvantifikaci PNPLA3 RNA.
[R-qPCR-PNPLA3 Kit, a prototype of the kit for PNPLA3 RNA quantification.]
Internal code: FV20479-1 PNPLA3 ; 2020
Technical parameters: R-qPCR-PNPLA3 Kit je souprava která je optimalizovaná z hlediska složení a způsobu užití na průkaz PNPLA3 RNA ligační metodou. V současné době se jedná o možnosti komerčního využití této soupravy u příjemce dotace, firmy Top-Bio, s.r.o., IČO 64578895, Průmyslová 596, 252 50 Vestec, Tel. 603476934
Economic parameters: Uvedením soupravy na trh může dojít k zvýšení objemu výroby a zisku výrobců souprav pro stanovení PNPLA3 RNA.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Gene expression * PNPLA3 * RNA quantification * polymerase chain reaction * SYBR green I * ligation of DNA probes * quantitative PCR
OECD category: Biochemistry and molecular biology
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0312763 - 10.0534591 - ÚMG 2021 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Tůmová, Magda - Dráber, M. - Dráber, Petr
R-qPCR-SYBR Kit, prototyp univerzální soupravy pro kvantifikaci RNA ligační metodou.
[R-qPCR-SYBR Kit, a prototype of a universal kit for RNA quantification by the ligation method
.]
Internal code: FV20479-1 SYBR ; 2020
Technical parameters: R-qPCR-SYBR Kit je univerzální souprava která je optimalizovaná z hlediska složení a způsobu užití na průkaz RNA ligační metodou. V současné době se jedná o možnosti komerčního využití této univerzální soupravy u příjemce dotace, firmy Top-Bio, s.r.o., IČO 64578895, Průmyslová 596, 252 50 Vestec, Tel. 603476934
Economic parameters: Uvedením soupravy na trh může dojít k zvýšení objemu výroby a zisku výrobců souprav pro stanovení RNA.
R&D Projects: GA MPO FV20479
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Gene expression * RNA quantification * polymerase chain reaction * SYBR green I * ligation of DNA probes * quantitative PCR
OECD category: Biochemistry and molecular biology
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0312761