Search results
- 1.0574006 - ÚVGZ 2023 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Červený, Jan - Malaník, P. - Tinka, Jan - Drahanský, M.
Automatizovaný iluminační kultivátor - mikrořasová sběrnice.
[Automated illumination cultivator - microalgal interface.]
Internal code: optimALga_bioreactor ; 2023
Technical parameters: Řídící elektronika bioreaktoru se skládá z řídícího počítače, základní desky a měřících modulů. Základní deska obsahuje elektroniku potřebnou k řízení osvětlení, motorů a teploty. Měřící moduly v rámci cyklů provádí měření parametrů kultivované suspenze řas a výsledná data jsou přeposílána do řídícího počítače. Funkčnost ověřena v laboratorním prostředí
Economic parameters: 125 000,- Kč
R&D Projects: GA MPO(CZ) EG21_374/0026534
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : microalgae biotechnology * bioreactor * cyanobacteria * fluorescence kinetics * iot * optimization * phenotypization * automation * industry 4.0
OECD category: Electrical and electronic engineering
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0344373File Download Size Commentary Version Access Prototyp_-_Iluminační_kultivátor_mikrořasová_sběrnice.pdf 3 175.8 KB Publisher’s postprint open-access - 2.0524315 - ÚVGZ 2021 RIV CZ eng L4 - Software
Červený, Jan
Web Tool for Photobioreactor Data Analysis 1.0.
Internal code: DoAB_PBR-DataAnalysis ; 2020
Technical parameters: Programatická realizace pokročilé analýzy vědeckých dat generovaných mikrořasovými kultivártory. K realizaci nástroje byl využit statistický programovací jazyk R a jeho nadstavba pro tvorbu interaktivních webových nástrojů Shiny. Zdrojová data pro analýzu jsou primárně očekávána ve výstupním standardu přístrojů firmy Photon Systems Instruments, s. r. o. Dále jsou podporovány vstupy v tabulkových formátech .csv a .xlsx.
Economic parameters: Využitím tohoto nástroje je dosaženo v průměru 70% zkrácení procesu zpracování a analýzy dat generovaných výkonnými mikrořasovými kultivátory. Automatizace analýzy a použitých přístupů dále spolu s gereováním standardizovaných výstupů zajišťuje efektivnější reporting a přípravu dat pro další stupeň analýzy dat, což vede v průměru k 80% zkrácení časových nároků na analýzu kultivačních dat. K dnešnímu dni bylo celosvětově prodáno více než 500 zařízení, na jejich datové výstupy lze nástroj použít.
R&D Projects: GA TA ČR(CZ) TN01000048
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : photobioreactor * microalgae * characterization * phenotypization * biotechnology * data science * algorithms * tidy data
OECD category: Plant sciences, botany
https://czechglobe-doab.shinyapps.io/PBR-DataAnalysis/
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0308681 - 3.0504416 - ÚVGZ 2020 RIV CZ eng L4 - Software
Červený, Jan
Photobioreactor Control Scripts 1.0.
Internal code: DoAB_PBR-ControlScripts ; 2019
Technical parameters: Programatická realizace řídících skriptů využívá originálníh aplikčního rozhraní pro přístup k měřeným veličinám a akčním prvkům fotobioreaktorů a umožňuje tak implementaci algoritmů pro automatickou fenotypizaci a optimalizaci kultivovaných mikroorganismů a výzarné zefektivnění těchto procesů.
Economic parameters: Využitím těchto skriptů je dosaženo v průměru 60% zkrácení procesu detailní charakterizace a výzkumu kultivovaných mikroorganismů v porovnání s procesem kontrolovaným operátorem kultivace. Automatické zpracování dat pak dále přináši v průměru 75% navýšení objemu zpracovaných dat za časovou jednotku a umožnuje včasnou detekci nestabilit a nestandardních odezev zkoumaného biosystému v reálném čase. Vedle zkrácení kultivačního procesu a zefektivnění zpracování výstupních dat jsou zajištěny opakovatelnost a robustnost celého procesu. K dnešnímu dni bylo celosvětově prodáno více než 500 zařízení, u kterých je možné tyto skripty použít.
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Research Infrastructure: CzeCOS II - 90061
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : computational control * regulation * photobioreactor * microalgae * optimization * phenotypization * biotechnology * data acquisition * algorithms
OECD category: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
https://smartbiotech.github.io/PBR-ControlScripts/
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0296057 - 4.0498288 - ÚVGZ 2019 RIV US eng J - Journal Article
Červený, Jan - Schreiber, I. - Šafránek, D.
2018 International Conference on Biotechnology and Bioengineering (ICBB2018), Budapest, Hungary, 24-26 October 2018.
Basic & Clinical Pharmacology & Toxicology. Roč. 124, č. 1 (2018), s. 3-43. ISSN 1742-7835. E-ISSN 1742-7843
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : phenotypization * microalgae * biotechnology * systems biology * modeling * online tools
OECD category: Environmental biotechnology
Impact factor: 2.452, year: 2018
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0290677 - 5.0498285 - ÚVGZ 2019 RIV US eng A - Abstract
Červený, Jan - Schreiber, I. - Šafránek, D.
Systems biology approaches for advancing biotechnology of microalgae.
Basic & Clinical Pharmacology & Toxicology. Wiley. Roč. 124, č. 1 (2018), s. 8-8. ISSN 1742-7835. E-ISSN 1742-7843.
[International Conference on Biotechnology and Bioengineering. 24.12.2018-26.12.2018, Budapešť]
Institutional support: RVO:86652079
Keywords : phenotypization * microalgae * biotechnology * systems biology * modeling * online tools
OECD category: Environmental biotechnology
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0290674