Search results
- 1.0327972 - ÚOCHB 2010 RIV DE eng J - Journal Article
Berka, Karel - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
Analysis of Energy Stabilization inside the Hydrophobic Core of Rubredoxin.
ChemPhysChem. Roč. 10, č. 3 (2009), s. 543-548. ISSN 1439-4235. E-ISSN 1439-7641
R&D Projects: GA ČR GA203/05/0009; GA ČR GA203/06/1727; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Institutional research plan: CEZ:AV0Z40550506
Keywords : hydrophobic core * protein stability * SAPT method
Subject RIV: CF - Physical ; Theoretical Chemistry
Impact factor: 3.453, year: 2009
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0174393 - 2.0091972 - ÚOCHB 2008 RIV DE eng J - Journal Article
Vondrášek, Jiří - Kubař, Tomáš - Jenney, Jr., F. E. - Adams, M. W. W. - Kožíšek, Milan - Černý, Jiří - Sklenář, V. - Hobza, Pavel
Dispersion interactions govern the strong thermal stability of a protein.
[Londonovy disperzní interakce určují vysokou termostabilitu proteinu.]
Chemistry - A European Journal. Roč. 13, č. 32 (2007), s. 9022-9027. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
R&D Projects: GA MŠMT 1M0508; GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510; GA ČR GA203/06/1727; GA ČR(CZ) GD203/05/H001
Institutional research plan: CEZ:AV0Z40550506
Keywords : ab initio calculations * hydrophobic core * hydrophobic effect * molecular modeling * NMR spectroscopy
Subject RIV: CF - Physical ; Theoretical Chemistry
Impact factor: 5.330, year: 2007
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0152431 - 3.0048612 - ÚOCHB 2007 RIV US eng J - Journal Article
Otyepka, M. - Sklenovský, P. - Horinek, Dominik - Kubař, Tomáš - Hobza, Pavel
How the Stabilization of INK4 Tumor Suppressor 3D Structure Evaluated by Quantum Chemical and Molecular Mechanics Calculations Corresponds Well with Experimental Results: Interplay of Association Enthalpy, Entropy, and Solvation Effects.
[Stabilizace struktury proteinu INK4 určená kvantově-chemickými výpočty molekulové mechaniky souhlasí s experimentálními výsledky: souhra asociační entalpie, entropie a solvatačních efektů.]
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 110, č. 9 (2006), s. 4423-4429. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
R&D Projects: GA MŠMT LC512
Institutional research plan: CEZ:AV0Z40550506
Keywords : free energy * hydrophobic core * quantum chemistry
Subject RIV: CF - Physical ; Theoretical Chemistry
Impact factor: 4.115, year: 2006
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0003776 - 4.0027136 - ÚOCHB 2006 RIV US eng J - Journal Article
Vondrášek, Jiří - Bendová, Lada - Klusák, Vojtěch - Hobza, Pavel
Unexpectedly strong energy stabilization inside the hydrophobic core of small protein Rubredoxin mediated by aromatic residues: correlated ab initio quantum chemical calculations.
[Vyjímečně silná energetická stabilizace uvnitř hydrofobního jádra Rubredoxinu zprostředkovaná aromatickými aminokyselinami. Výpočty kvantově chemickými metodami ab initio.]
Journal of the American Chemical Society. Roč. 127, č. 8 (2005), s. 2615-2619. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
R&D Projects: GA AV ČR(CZ) IAA400550510
Institutional research plan: CEZ:AV0Z4055905
Keywords : hydrophobic core * globular proteins * stabilization
Subject RIV: CF - Physical ; Theoretical Chemistry
Impact factor: 7.419, year: 2005
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0117262