Search results
- 1.0586305 - BC 2024 RIV GB eng J - Journal Article
Záhonová, Kristýna - Füssy, Z. - Stairs, C.W. - Leger, M.M. - Tachezy, J. - Čepička, I. - Roger, A.J. - Hampl, V.
Comparative analysis of mitochondrion- related organelles in anaerobic amoebozoans.
Microbial Genomics. Roč. 9, č. 11 (2023), č. článku 001143. ISSN 2057-5858. E-ISSN 2057-5858
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institutional support: RVO:60077344
Keywords : glycine cleavage system * molecular evidence * reaction-mechanism * carrier family * l-threonine * protein * archamoebae * entamoeba * evolution * diversity * reductive evolution * mitochondrion-related organelles * anaerobiosis * comparative genomics
OECD category: Microbiology
Impact factor: 3.9, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen.0.001143
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0353858 - 2.0580702 - MBÚ 2025 RIV NL eng J - Journal Article
Kovář, Marek - Šubr, Vladimír - Běhalová, Kateřina - Studenovský, Martin - Starenko, Daniil - Kovářová, Jiřina - Procházková, Petra - Etrych, Tomáš - Kostka, Libor
Chemosensitization of tumors via simultaneous delivery of STAT3 inhibitor and doxorubicin through HPMA copolymer-based nanotherapeutics with pH-sensitive activation.
Nanomedicine: Nanotechnology, Biology and Medicine. Roč. 56, February 2024 (2024), s. 102730. ISSN 1549-9634. E-ISSN 1549-9642
R&D Projects: GA MZd(CZ) NU21-03-00273; GA MŠMT LX22NPO5102
Institutional support: RVO:61388971 ; RVO:61389013
Keywords : STAT3 inhibitor * Doxorubicin * HPMA copolymer carrier * pH-sensitive drug * release
OECD category: Pharmacology and pharmacy; Medicinal chemistry (UMCH-V)
Impact factor: 5.4, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1549963423000813
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0349459File Download Size Commentary Version Access 0580702.pdf 1 5 MB CC BY license Publisher’s postprint open-access Kovar et al_Nanomedicine.pdf 0 5 MB Publisher’s postprint open-access - 3.0578767 - ÚMCH 2024 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Bača, Ondrej - Chytil, Petr - Etrych, Tomáš - Urban, M. - Jurčeka, O.
Polymerní konjugát pro dopravu 30-oxobetulinové kyseliny.
[Polymer nanomedicine for delivery of 30-oxobetulinic acid.]
Internal code: OB5 ; 2023
Technical parameters: Jedná se o konjugát vodorozpustného kopolymeru na bázi N-(2-hydroxypropyl)methakrylamidu obsahujícího primární amino skupiny s funkčním derivátem betulinové kyseliny obsahující aldehydovou skupinu. Reakcí primárních aminoskupin polymerního nosiče a aldehydové skupiny derivátu betulinové kyseliny vznikne vodorozpustný polymerní konjugát s obsahem léčiva až do 5 hm%. Polymerní konjugát s léčivem o velikosti okolo deseti nanometrům je vhodný pro intravenózní nebo intraperitoneální aplikaci, při které nedochází k systémové zátěži organismu. Léčivo je z nosiče pomalu uvolňováno během transportu krví nebo po vstupu do nádorové tkáně. Díky prodloužené cirkulaci polymerního nosiče a pasivní akumulaci v nádorové tkáni je tak zajištěna větší dostupnost léčiva a vyšší protinádorová účinnost. Po uvolnění léčiva dojde k postupnému vyloučení polymerního nosiče ledvinami z organizmu. Ani při opakovaném podání proto nedochází k akumulaci polymerního nosiče v těle. Osoba pro jednání: Tomáš Etrych
Economic parameters: Klasická chemoterapie pomocí nízkomolekulárních léčiv mívá řadu nevýhod. Špatná rozpustnost hydrofobních léčiv a omezená dostupnost účinné látky v postižené tkáni snižuje efektivitu léčby, nemluvě o případných vedlejších účincích léčby dané nespecifičností léčiv. Všechny tyto nevýhody vedou k navýšení ekonomických výdajů léčby, léčba nebývá dostatečně účinná, pacient zůstává po dlouhodou dobu v léčebném procesu a vedlejší účinky chemoterapeutických léčiv mohou způsobit významně snížený komfort pro pacienta a další vícenáklady pro zdravotní systém. Navázáním léčiva na polymerní nosič dochází k výraznému prodloužení cirkulaci léčiva v krvi a jeho pomalému uvolňování v krevním řečišti nebo v cílové nádorové tkáni. Tímto se významně navýší dostupnost léčiva během léčby a s tím spojená protinádorová účinnost. Přidanou hodnotou uvedeného systému je tedy zlepšení kvality života pacientů, zvýšení terapeutického účinku použitých léčiv, a tím i ušetření finančních prostředků, vynakládaných ze zdravotního pojištění.
R&D Projects: GA MŠMT LX22NPO5102
Institutional support: RVO:61389013
Keywords : polymeric carrier * HPMA copolymer * drug delivery * betulinic acid * derivative
OECD category: Polymer science
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0347687 - 4.0574217 - FZÚ 2024 RIV CH eng J - Journal Article
Im, C. - Kang, S.W. - Choi, J. Y. - An, J. - Mičová, J. - Remeš, Zdeněk
Spatial balance of photogenerated charge carriers in active layers of polymer solar cells.
Molecules. Roč. 28, č. 15 (2023), č. článku 5823. E-ISSN 1420-3049
Institutional support: RVO:68378271
Keywords : polymeric photovoltaics * non-fullerene acceptors * internal absorption * internal quantum efficiency * transfer matrix method * spatial balance * charge carrier distribution
OECD category: Condensed matter physics (including formerly solid state physics, supercond.)
Impact factor: 4.6, year: 2022
Method of publishing: Open access
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0344562File Download Size Commentary Version Access 0574217.pdf 0 3.7 MB CC licence Publisher’s postprint open-access - 5.0571634 - FZÚ 2024 RIV DE eng J - Journal Article
Kolb, F. - El Gemayel, M. - Khan, I. - Dostálek, Jakub - Trattnig, R. - Sommer, C. - List-Kratochvil, E.J.W.
The impact of plasmonic electrodes on the photocarrier extraction of inverted organic bulk heterojunction solar cells.
Applied Physics A - Materials Science & Processing. Roč. 129, č. 3 (2023), č. článku 230. ISSN 0947-8396. E-ISSN 1432-0630
Institutional support: RVO:68378271
Keywords : organic solar cells * electrode patterning * optical enhancement * surface plasmons * dielectric waveguide modes * charge carrier extraction
OECD category: Electrical and electronic engineering
Impact factor: 2.7, year: 2022
Method of publishing: Open access
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0346101File Download Size Commentary Version Access 0571634.pdf 0 4.7 MB CC licence Publisher’s postprint open-access - 6.0571251 - ÚMCH 2024 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Etrych, Tomáš - Pola, Robert - Grosmanová, Eliška - Karabínoš, P.
pH-senzitivní polymerní sonda aktivně směrovaná k EGF receptorům pro fluorescenčně naváděnou endoskopickou chirurgii.
[pH-sensitive polymeric nanoprobe actively targeted to EGF receptors for fluorescence-guided endoscopic surgery.]
Internal code: PZ129 ; 2023
Technical parameters: Vzorek je směrovaná polymerní sonda na bázi kopolymeru N (2 hydroxypropyl)methakrylamidu (HPMA) s navázaným fluoroforem Cy7. Směrující oligopeptid YHWYGYTPQNVI (peptid GE-11) je v sondě zodpovědný za aktivní směrování k EGF receptorům na nádorových buňkách. Druhou komponentou je značka Cy7, která je k polymernímu nosiči připojena pH-senzitivní hydrazonovou vazbou, pomalu hydrolyzovanou v neutrálním pH (krevní řečiště) a rychle hydrolyzovatelnou v kyselém pH (prostředí nádoru). Sonda využívá efektu zhášení, kdy se po navázání na polymer se díky interakcím molekul fluoroforů mezi sebou zháší jejich fluorescence. Při cirkulaci v krevním řečišti jsou fluorofory ve zhasnuté formě a po volnění z polymerního nosiče v kyselém prostředí nádorové tkáně jsou odštěpeny a fluorescence je plně reaktivována. Výsledná polymerní sonda byla připravena navázáním peptidu GE-11 na polymerní prekurzor za využití „click“ chemie a zároveň navázáním derivátu Cy7 pomocí pH-senzitivní hydrazonové vazby. Osoba pro jednání: Tomáš Etrych, vedoucí Oddělení biolékařských polymerů.
Economic parameters: Nádory hlavy a krku jsou šestým nejčetnějším typem rakovinného onemocnění. I v současné medicíně je léčba primárně založena na chirurgickém odstranění nádoru s následnou adjuvantní chemoterapií cytostatiky. Klíčovou roli v chirurgické resekci nádorů hlavy a krku hraje dostatečná radikalita zákroku, tedy odstranění celé masy tumoru, a to i za cenu odstranění zdravých částí tkáně v blízkém okolí, což však přináší rizika trvalých následků (poruchy polykání, fonace či artikulace). Z tohoto důvodu je v poslední době zvýšená pozornost věnovaná navigované chirurgii. Využití pH-senzitivních fluorescenčních sond aktivně směrovaných přímo do nádorové tkáně dokáže zvýšit přesnost chirurgického výkonu a tím zmenšit resekční okraj. To vede k většímu zachování zdravé tkáně v okolí a snížení počtu trvalých následků a počtu recidivujících nádorů. V důsledku toho dojde ke snížení nákladů z veřejného pojištění nutných pro následnou rekonvalescenci pacientů, nebo onkologickou péči při recidivách.
R&D Projects: GA MZd(CZ) NU21-08-00280
Keywords : targeted polymer carrier * endoscopic surgery * probe
OECD category: Polymer science
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0342524 - 7.0570728 - ÚMCH 2024 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Etrych, Tomáš - Pola, Robert - Grosmanová, Eliška - Karabínoš, P.
pH-senzitivní polymerní sonda pro fluorescenčně naváděnou endoskopickou chirurgii.
[pH-sensitive polymeric nanoprobe for fluorescence-guided endoscopic surgery.]
Internal code: DH38 ; 2023
Technical parameters: Vzorkem je polymerní sonda na bázi kopolymeru N (2 hydroxypropyl)methakrylamidu s navázaným fluoroforem Cy7, který byl k polymernímu nosiči připojen pH-senzitivní hydrazonovou vazbou, štěpitelnou v kyselém prostředí nádoru. Polymerní sonda je navržena tak, že její fluorescence je významně ponížena ve formě polymerní sondy, a po uvolnění fluoroforu ze sondy v nádorové tkáni dojde k významné aktivaci signálu. Polymerní prekurzor byl připraven řízenou RAFT kopolymerací. Připravený polymer má úzkou distribuci molárních hmotností, která byla stanovena pomocí SEC. Výsledná polymerní sonda byla připravena navázáním derivátu Cy7 na připravený polymerní prekurzor za vzniku pH-senzitivní hydrazonové vazby mezi těmito molekulami. Sonda neuvolňuje fluorofor během cirkulace v krevním řečišti, naopak po poklesu pH v rámci nádorové tkáně dochází k významnému nárůstu fluorescence, která může být využita pro navigovanou chirurgii. Polymerní sonda má hydrodynamickou velikost, která umožňuje její akumulaci v pevných nádorech. Osoba pro jednání: Tomáš Etrych, vedoucí Oddělení biolékařských polymerů
Economic parameters: Současná léčba nádorů hlavy a krku je založena na chirurgickém odstranění nádoru následovaném chemoterapeutickým doléčením. Klíčovou rolí při úspěšné resekci nádoru je odstranění veškerých nádorových buněk, což je často dosahováno i při riziku odebrání okolní zdravé tkáně. V těchto případech může být tato radikální resekce spojena s riziky trvalých následků (poruchy polykání, fonace či artikulace). V poslední dekádě je zvýšená pozornost věnována navigované chirurgii, která by mohla významně přispět k úspěšnosti odstranění nádorové masy bez nutnosti odebírání zdravé okolní tkáně. Ekonomický parametr výsledku spočívá v navýšení přesnosti chirurgie s využitím pH-senzitivních sond, u nichž je fluorescenční signál aktivován v nádoru. Zvýšení účinnosti chirurgického odstranění při zachování funkce okolních zdravých orgánů je hlavním ekonomickým benefitem, který povede ke snížení nákladů z veřejného pojištění nutných pro následnou onkologickou léčbu recidivujících nádorů nebo na rekonvalescenci pacientů po zákroku.
R&D Projects: GA MZd(CZ) NU21-08-00280
Keywords : polymer carrier * endoscopic surgery * probe
OECD category: Polymer science
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0342069 - 8.0569152 - ÚFCH JH 2025 RIV US eng J - Journal Article
Smith, David - Španěl, Patrik - Demarais, N. - Langford, V. S. - McEwan, M. J.
Recent developments and applications of selected ion flow tube mass spectrometry (SIFT-MS).
Mass Spectrometry Reviews. (2023), č. článku e21835. ISSN 0277-7037. E-ISSN 1098-2787
R&D Projects: GA ČR(CZ) GA21-25486S
Institutional support: RVO:61388955
Keywords : cation and anion gas phase chemistry * nitrogen carrier gas * selected ion flow tube mass spectrometry * sift-ms * VOCs * volatile organic compounds
OECD category: Physical chemistry
Impact factor: 6.7, year: 2022
Method of publishing: Open access
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0340488File Download Size Commentary Version Access 0569152preprint.pdf 0 2.3 MB Author´s preprint open-access - 9.0565955 - ÚOCHB 2023 RIV CH eng J - Journal Article
Tonduru, A. K. - Adla, Santosh Kumar - Huttunen, K. M. - Kronenberger, T. - Poso, A.
Comparative Modelling of Organic Anion Transporting Polypeptides: Structural Insights and Comparison of Binding Modes.
Molecules. Roč. 27, č. 23 (2022), č. článku 8531. E-ISSN 1420-3049
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) EF20_079/0017783
Institutional support: RVO:61388963
Keywords : organic anion transporting polypeptides (OATPs) * molecular dynamics simulations * homology models * xenobiotic transporters * Solute-Carrier O (SLCO)
OECD category: Organic chemistry
Impact factor: 4.6, year: 2022
Method of publishing: Open access
https://doi.org/10.3390/molecules27238531
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0337423
Research data: Zenodo - 10.0565593 - ÚMCH 2023 RIV CZ cze L - Prototype, f. module
Kostka, Libor - Šubr, Vladimír
Polymerní léčivo na bázi hydrofilního polymeru nesoucí oxoderivát lopinaviru.
[Polymer nanomedicine based on hydrophilic polymer carrier of Lopinavir oxo derivative.]
Internal code: LK772-LD ; 2022
Technical parameters: Vodorozpustný polymerní nosič se skládá z poly(N-(2-hydroxypropyl)methakrylamid)ového kopolymeru s hydrazidem aminohexanové kyseliny. Umí cíleně dopravit do pevného nádoru až 10 hm% léčiva Lopinaviru, aniž by ztratil charakter plně rozpustného systému. Konjugát o velikosti 8 – 12 nm je vhodný pro intravenózní aplikaci, při které v tomto případě nedochází k systémové zátěži organismu. Léčivo je z nosiče uvolňováno pouze v nádorové tkáni díky poklesu hodnoty pH. Díky efektu zvýšené propustnosti a zádrže, charakteristickému a specifickému pro pevné nádory, dochází k cílené akumulaci polymerního léčiva právě v nádorové tkáni. Po dopravě léčiva do nádorové tkáně dochází k návratu polymerního nosiče do krve, kde dojde k jeho postupnému vyloučení ledvinami z organizmu. Takže ani při opakovaném podání nedochází k akumulaci polymerního nosiče v organizmu. Osoba pro jednání: Libor Kostka
Economic parameters: Vedlejší účinky klasické chemoterapie v protinádorové terapii, založené na nízkomolekulárních léčivech, mohou vést u pacientů k závažnému poškození organismu způsobujícímu další ekonomické výdaje. Při systémovém podání cytostatika dochází k velmi nízké specifické akumulaci v nádoru. A výraznému postižení zdravých orgánů. Navázáním cytostatika na polymerní nosič dochází k cirkulaci léčiva v neaktivní formě, a tudíž k téměř nulové zátěži zdravých orgánů. Díky efektu zvýšené propustnosti a zádrže, charakteristickému a specifickému pro pevné nádory, dochází k cílené akumulaci polymerního léčiva právě v nádorové tkáni. Polymerní léčiva mají výrazně vyšší akumulaci v nádorové tkáni než pouze nízkomolekulární léčivo. Přidanou hodnotou uvedeného systému je tedy zlepšení kvality života pacientů, zvýšení terapeutického účinku použitých léčiv, a tím i ušetření finančních prostředků, vynakládaných ze zdravotního pojištění.
R&D Projects: GA MZd(CZ) NU21-03-00273
Institutional support: RVO:61389013
Keywords : polymer carrier * HPMA * lopinavir
OECD category: Polymer science
Permanent Link: https://hdl.handle.net/11104/0337169