0502803 - ÚMG 2019 RIV CZ cze L4 - Software
Škuta, Ctibor - Svozil, Daniel
MolSetinspector.
[MolSetinspector.]
Internal code: Software-3 ; 2015
Technical parameters: MolSetInspector (Molecular Sets Inspector) je Python knihovna umožňující zpracování jedné či více množin chemických látek. Na vstupu přijímá adresář obsahující jeden či více souborů (sdf, csv, smi nebo txt), které mohou obsahovat molekuly v různých chemických formátech (smiles, inchi nebo molfile). MolSetInspector automaticky zjistí konkrétní formát, načte všechny molekuly a zpracuje. Během zpracování je možné používat základní možnosti standardizace molekul či odstranění stereochemie. Jako výstup knihovna umožňuje výpis množiny unikátních molekul ze všech načtených společně s informací o jejich přítomnosti v dané množině. Dále je možné vypsat tabulku s průniky jednotlivých množin, duplicitní molekuly, molekuly, které se nepovedlo načíst, nebo použít jednu ze dvou možností selekce diverzní množiny molekul (na základě maximální podobnosti nebo maximálního počtu molekul). http://openscreen.cz/software/molsetinspector
Economic parameters: Tato Python knihovna umožňuje zpracování jedné či více množin chemických látek.
R&D Projects: GA MŠMT LO1220
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Phyton * Molecular set * Hit table
OECD category: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
http://openscreen.cz/software/molsetinspector
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0294689
Škuta, Ctibor - Svozil, Daniel
MolSetinspector.
[MolSetinspector.]
Internal code: Software-3 ; 2015
Technical parameters: MolSetInspector (Molecular Sets Inspector) je Python knihovna umožňující zpracování jedné či více množin chemických látek. Na vstupu přijímá adresář obsahující jeden či více souborů (sdf, csv, smi nebo txt), které mohou obsahovat molekuly v různých chemických formátech (smiles, inchi nebo molfile). MolSetInspector automaticky zjistí konkrétní formát, načte všechny molekuly a zpracuje. Během zpracování je možné používat základní možnosti standardizace molekul či odstranění stereochemie. Jako výstup knihovna umožňuje výpis množiny unikátních molekul ze všech načtených společně s informací o jejich přítomnosti v dané množině. Dále je možné vypsat tabulku s průniky jednotlivých množin, duplicitní molekuly, molekuly, které se nepovedlo načíst, nebo použít jednu ze dvou možností selekce diverzní množiny molekul (na základě maximální podobnosti nebo maximálního počtu molekul). http://openscreen.cz/software/molsetinspector
Economic parameters: Tato Python knihovna umožňuje zpracování jedné či více množin chemických látek.
R&D Projects: GA MŠMT LO1220
Institutional support: RVO:68378050
Keywords : Phyton * Molecular set * Hit table
OECD category: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
http://openscreen.cz/software/molsetinspector
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0294689