Number of the records: 1
Detekce bakterií a archeí v půdě a v sedimentech pomocí metody CARD-FISH
- 1.
SYSNO ASEP 0350624 Document Type C - Proceedings Paper (int. conf.) R&D Document Type Conference Paper Title Detekce bakterií a archeí v půdě a v sedimentech pomocí metody CARD-FISH Title Detection of bacteria and archaea in soil and sediments using CARD-FISH method Author(s) Kahounová, Ludmila (BC-A)
Chroňáková, Alica (BC-A) RID, ORCID
Frouz, Jan (BC-A) RID, ORCID
Krištůfek, Václav (BC-A) RIDSource Title Život v pôde XI. Zborník z medzinárodného seminára. - Bratislava : Vydavateľstvo Univerzity Komenského, 2010 - ISBN 978-80-223-2796-1 Pages s. 80-96 Number of pages 17 s. Publication form CD-ROM - CD-ROM Action Život v pôde /11./ Event date 26.01.2010-27.01.2010 VEvent location Bratislava Country SK - Slovakia Event type EUR Language cze - Czech Country SK - Slovakia Keywords CARD-FISH ; pasture soil ; bat guano Subject RIV EH - Ecology, Behaviour R&D Projects LC06066 GA MŠMT - Ministry of Education, Youth and Sports (MEYS) GA206/09/1642 GA ČR - Czech Science Foundation (CSF) GA526/09/1570 GA ČR - Czech Science Foundation (CSF) CEZ AV0Z60660521 - UPB-H, BC-A (2005-2011) Annotation Pomocí metody CARD-FISH (catalyzed reporter deposition – fluorescence in situ hybridization) bylo detekováno mikrobiální zastoupení archeí, bakterií a aktinobakterií ve třech významně odlišných prostředích: v půdě podhorské pastviny, v netopýřím guánu z jeskyně a v miocenním sedimentu. V těchto rozdílných substrátech byly z naměřených dat vyhodnoceny rozdíly v mikrobiálním společenstvu a výsledky byly porovnány s celkovým počtem bakterií (DAPI) a počtem kolonií bakterií (CFU). V půdě podhorských pastvin rostl počet bakterií a archeí, stanovených pomocí CARD-FISH metody, s mírou zatížení půdy pastvou skotu. Tento trend potvrzovaly i celkové počty buněk (DAPI) a stanovení počtu CFU buněk. Nejvyšší počty bakterií a archeí v gramu suché půdy byly na ploše nejvíce ovlivněné pobytem skotu (3,97 x 109 resp. 3,62 x 108) a nejnižší na kontrolní ploše bez vlivu zvířat (0,55 x 109 resp. 0,35 x 108). Description in English The CARD-FISH (catalyzed reporter deposition - fluorescence in situ hybridization) method together with total bacterial counts (DAPI), colony forming units (CFU) and culturable-to-total (C/T) cell ratio was used to determine the prokaryotic community composition in three different types of samples: upland pasture soil, bat guano from cave and Miocene sediment. The occurrence of Archaea, Bacteria and major bacterial group Actinobacteria were studied using CARD-FISH analysis. In upland pasture soil, all quantitative characteristics (CARD-FISH-stained archeal and bacterial cells, DAPI, CFU and index C/T) increased considerably with the degree of animal impact. Absolute values for Bacteria, Archaea ranged from 0.55 x 109 to 3.97 x 109 cells g-1 dry soil and from 0.35 x 108 to 3.62 x 108 cells g-1 dry soil, respectively, being the highest at severe impacted site and the lowest at control soil. Workplace Biology Centre (since 2006) Contact Dana Hypšová, eje@eje.cz, Tel.: 387 775 214 Year of Publishing 2011
Number of the records: 1