0100863 - UOCHB-X 20043051 RIV GB eng J - Journal Article
Schneider, Bohdan - Morávek, Z. - Berman, H. M.
RNA conformational classes.
[Konformační třídy RNA.]
Nucleic Acids Research. Roč. 32, č. 5 (2004), s. 1666-1677. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
R&D Projects: GA MŠMT LN00A032
Institutional research plan: CEZ:AV0Z4055905
Keywords : RNA conformation
Subject RIV: CF - Physical ; Theoretical Chemistry
Impact factor: 7.260, year: 2004

RNA exhibits a large diversity of conformations. Three thousand nucleotides of 23S and 5S ribosomal RNA from a structure of the large ribosomal subunit were analyzed in order to classify their conformations. Fourier averaging of the six 3D distributions of torsin angles and analyses of the resulting pseudo electron maps, followed by clustering of the preferred combinations of torsion angles were performed on this dataset

Tři tisíce nukleotidů ze struktury velké ribosomové jednotky, PDB ID 1JJ2, byly analyzovány a bylo ukázáno, že přes jejich extremní diversitu, nukleotidové konformace mohou být klasifikovány. Metodou Fourierovského průměrování a klastrováním bylo identifikováno 32 konformačních tříd, 18 z nich radikálně odlišných od A-RNA
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0008349