Number of the records: 1  

An approach towards experimental cDNA sequence determination of predicted genes: An example from Arabidopsis U3-55k homologues

  1. 1.
    0026949 - ÚMG 2006 RIV NL eng J - Journal Article
    Urbánek, Pavel - Pačes, Jan - Pačes, Václav
    An approach towards experimental cDNA sequence determination of predicted genes: An example from Arabidopsis U3-55k homologues.
    [Přístup k experimentálnímu stanovování sekvence cDNA předpovězených genů:.]
    Gene. Roč. 358, - (2005), s. 67-72. ISSN 0378-1119. E-ISSN 1879-0038
    R&D Projects: GA AV ČR(CZ) IAA5052802; GA MŠMT(CZ) 1M0520
    Institutional research plan: CEZ:AV0Z50520514
    Keywords : Trichostatin A * 5-aza-2´-deoxycytidine * WD repeat
    Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
    Impact factor: 2.694, year: 2005

    A repressed gene of Arabidopsis thaliana that codes for a homologue of the U3-55K proteins from Arabidopsis, man, mouse, yeast and other eukaryotes was characterized. Treatment with inhibitors of histone deacetylases or DNA methyltransferases induced a low level of mRNA from the repressed Arabidopsis gene. Sequencing of RT-PCR products revealed the open reading frame that differs, in part, from the hypothetical one and encodes a seven-WD-repeat protein highly similar to U3-55K proteins from diverse eukaryotic species. The described approach may help to determine transcript sequences from predicted genes with a low level of expression.

    Byl charakterizován reprimovaný gen Arabidopsis thaliana, který kóduje homolog proteinů U3-55K z Arabidopsis, člověka, myši, kvasinky a dalších eukaryot. Působení inhibitory deacetylas histonů nebo DNA methyltransferas indukovalo nízkou hladinu mRNA z reprimovaného genu Arabidopsis. Sekvenování produktů RT-PCR ukázalo otevřený čtecí rámec, který se částečně liší od hypotetického a kóduje protein obsahující sedm repeticí typu WD, velice podobný proteinům U3-55K z rozličných druhů eukaryot. Popsaný přístup může pomoci při stanovování sekvencí transkriptů z předpovězených genů s nízkou hladinou exprese.
    Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0117098

     
     
Number of the records: 1  

  This site uses cookies to make them easier to browse. Learn more about how we use cookies.