Interactions of mutant p53 with non-B structures in genomic DNA and consequences for gene expression in vivo

0334515 - BFÚ 2010 IL eng A - Abstract
Brázdová, Marie - Quante, T. - Tichý, Vlastimil - Navrátilová, Lucie - Loscher, Ch. - Lexa, M. - Martínek, T. - Tolstonong, G. - Fojta, Miroslav - Paleček, Emil - Deppert, W.
Interactions of mutant p53 with non-B structures in genomic DNA and consequences for gene expression in vivo.
[Interakce mutantních p53 s non-B strukturami v genomické DNA a konsekvence pro expresi genů in vivo.]
Abstract. Akko, 2009. s. 25.
[4th International Workshop on Mutant p53 "In vivo effects of mutant p53: experimental data, animal models, clinical consequences". 26.03.2009-30.03.2009, Akko]
R&D Projects: GA MŠMT(CZ) 1K04119; GA MŠMT(CZ) LC06035; GA AV ČR(CZ) IAA500040701; GA ČR(CZ) GP204/06/P369; GA ČR(CZ) GA204/08/1560
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Keywords : p53 mutants * p53 to DNA binding * mode of
Subject RIV: BO - Biophysics

The molecular Biological and computational approaches suggest that the mutant p53 proteins bind selectively non-B DNA structures not only in vitro but also with functional consequences in vivo. To study the specific gene regulation two glioblastoma cell lines were used (U251 and Onda11). Computational tools were developed, too, to predict formation of triplex and cruciform structures.

Molekulárně biologický a počítačový přístup naznačují, že mutované p53 proteiny se váží selektivně na non-B DNA struktury nejen in vitro, ale také in vivo, včetně funkčních důsledků. Ke studiu specifické regulace genů byly použity dvě buněčné linie glioblastomu (U251 a Onda11). Také byly vyvinuty počítačové postupy k předpovědi tvorby triplexových a kruciform struktur.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0179228