Vyhodnocování růstu kolonií kvasinek Saccharomyces cerevisia s použitím akcelerátoru Uni1P/DX64

0316842 - ÚTIA 2009 RIV CZ cze L4 - Software
Kloub, Jan - Schier, Jan
Vyhodnocování růstu kolonií kvasinek Saccharomyces cerevisia s použitím akcelerátoru Uni1P/DX64.
[Evaluation of growth of the Saccharomyces cerevisia yeast colonies using an edge detector implemented in the Uni1P acceleration board.]
Internal code: Tech. Zpráva ; 2008
Technical parameters: Tech. Zpráva + CD-ROM
Economic parameters: vyhodnocování s použitím akcelerátoru
R&D Projects: GA AV ČR 1ET400750408
Institutional research plan: CEZ:AV0Z10750506
Keywords : image processing * FPGA * yeast colonies * edge detection * acceleration
Subject RIV: JC - Computer Hardware ; Software

Tento dokument popisuje implementaci aplikace pro předzpracování obrazu pro kvantitativní analýzu růstu kolonií kvasinek, prováděnou z obrazu těchto kolonií na platformě Uni1P/DX64. Pro vyhodnocení experimentů je nutné stanovit relativní plochu, hmotnost a počet kolonií na misce v průběhu času. Pro vyhodnocení plochy a počtu kolonií se používá snímkování Petriho misek digitální kamerou. Dokument stručně popisuje prototyp software pro nalezení středu misky a akceleraci hranové detekce pomocí DSP/FPGA modulu DX64.

Document describes implementation of an image preprocessing application for the quantitave analysis of the yeast colonies growth. This analysis uses an image of colonies taken by a digital camera, which is processed using the Uni1P/DX64 platform. To evaluate the experiments, it is necessary to determine time evolution of relative area, mass, and number of colonies on the dish. Document briefly describes software prototype used to find the position of the dish center and to accelerate edge detection using the DX64 DSP/FPGA module.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0166648