Genetic diversity of Cobitis spp. (Cypriniformes: Cobitidae) from different drainage areas

0342006 - ÚBO 2010 RIV CZ eng J - Journal Article
Papoušek, Ivo - Lusková, Věra - Koščo, J. - Lusk, Stanislav - Halačka, Karel - Povž, M. - Šumer, S.
Genetic diversity of Cobitis spp. (Cypriniformes: Cobitidae) from different drainage areas.
[Genetická diverzita druhů rodu Cobitis (Cypriniformes: Cobitidae) z různých povodí.]
Folia zoologica. Roč. 57, 1-2 (2008), s. 83-89. ISSN 0139-7893. E-ISSN 1573-1189.
[Loaches of the genus Cobitis and related genera /3./. Šibenik, 24.09.2006-29.09.2006]
R&D Projects: GA MŽP SM/6/3/05
Keywords : Danubian spined loach * population diversity
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology
Impact factor: 0.522, year: 2008
http://www.ivb.cz/folia/57/1-2/083-089_MS1291.pdf

Genetic diversity of three pure populations of Cobitis elongatoides from hydrologically and geographically different drainage areas, the Lužnice River (48.49.60 N, 14.55.60 E, Labe River drainage area, North Sea basin), the Nová Říše reservoir (49.09.11 N, 15.32.464 E, Morava River drainage area, Black Sea basin), and the Ida River (48.32.284 N, 21.03.421 E, Tisza River drainage area, Black Sea basin) was evaluated by sequencing of mitochondrial cytochrome b gene. Species identification of unknown Cobitis samples from Vipava River drainage area in Slovenia was also performed based on cytochrome b sequence. All forms of the genus Cobitis are protected by national legislatives and they enjoy protection in selected localities of European importance. In total, 11 haplotypes of Cobitis elongatoides were found in Czech and Slovak waters, manifesting low overall genetic diversity. Samples from Vipava River drainage area were identified as Cobitis bilineata.

Pomocí sekvencování mitochondriálního genu pro cytochrom b byla zhodnocena genetická diverzita tří čistých populací Cobitis elongatoides z hydrologicky a geograficky odlišných povodí: Lužnice (48.49.60 N, 14.55.60 E, povodí Labe, úmoří Severního moře), vodní nádrž Nová Říše (49.09.11 N, 15.32.464 E, povodí Moravy, úmoří Černého moře) a Ida (48.32.284 N, 21.03.421 E, povodí Tisy, úmoří Černého moře). Dále byla na základě sekvence genu pro cytochrom b provedena druhová identifikace neznámých vzorků rodu Cobitis z povodí řeky Vipavy ve Slovinsku. Všechny formy rodu Cobitis jsou chráněny národními legislativami a těší se ochraně na vybraných lokalitách celoevropské důležitosti. Celkem bylo v českých a slovenských vodách nalezeno 11 haplotypů Cobitis elongatoides, s prokázanou malou celkovou genetickou diverzitou. Vzorky z povodí Vipavy byly identifikovány jako Cobitis bilineata.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0184837