The Amino Group in Adenine: MP2 and CCSD(T) Complete Basis Set Limit Calculations of the Planarization Barrier and DFT/B3LYP Study of the Anharmonic Frequencies of Adenine

0318446 - ÚOCHB 2009 RIV US eng J - Journal Article
Zierkiewicz, W. - Komorowski, L. - Michalska, D. - Černý, Jiří - Hobza, Pavel
The Amino Group in Adenine: MP2 and CCSD(T) Complete Basis Set Limit Calculations of the Planarization Barrier and DFT/B3LYP Study of the Anharmonic Frequencies of Adenine.
[Aminoskupina v adeninu: MP2 a CCSD(T) výpočty planarizační bariéry a DFT/B3LYP studie anharmonických frekvencí adeninu.]
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 112, č. 51 (2008), s. 16734-16740. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
R&D Projects: GA MŠMT LC512; GA MŠMT LN00A032
Institutional research plan: CEZ:AV0Z40550506
Keywords : adenine * MP2 * CCSD(T) * IR spectra
Subject RIV: CF - Physical ; Theoretical Chemistry
Impact factor: 2.871, year: 2008

The amino group in adenine plays a key role in formation of hydrogen bonds in nucleic acids and in other molecular systems. Thus, the structure of this group is of fundamental importance in the molecular recognition phenomena. Ab initio MP2 and density functional B3LYP methods with various basis sets have been used to calculate the optimized structure and the infrared spectrum of adenine (the N9-H tautomer).

Aminoskupina adeninu hraje klíčovou úlohu při tvorbě vodíkové vazby v nukleových kyselinách a jiných systémech. Struktura této skupiny tak hraje významnou úlohu v procesu molekulového rozpoznání. Ab initio MP2 a DFT/B3LYP výpočty s různě velkými basemi atomových orbitalů byly použity pro optimalizaci stuktury adeninu a výpočtu IČ spekter (N9-H tautomer).
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0004962