Phylogeography of Southern European Refugia

0041164 - ÚŽFG 2007 RIV NL eng M - Monography Chapter
Kotlík, Petr - Berrebi, P.
Nested clade phylogeographical analysis of barbel (Barbus barbus) mitochondrial DNA variation.
[Aplikace metody fylogeografické analýzy hnízdovaných kládů na variabilitu mitochondriální DNA parmy obecné (Barbus barbus).]
Phylogeography of Southern European Refugia. Dordrecht: Springer, 2007 - (Weiss, S.; Ferrand, N.), s. 315-325. ISBN 1-4020-4903-X
R&D Projects: GA AV ČR KJB600450507
Institutional research plan: CEZ:AV0Z50450515
Keywords : isolation by distance * mtDNA * phylogeography
Subject RIV: EB - Genetics ; Molecular Biology

We applied nested clade phylogeographical analysis (NCPA) to the mitochondrial DNA phylogeographical data of the barbel (Barbus barbus) to assess the historical biogeography scenario suggested for this species by a traditional phylogeographical approach. Major previously inferred historical events received support from the NCPA. Some processes were not inferred likely due to insufficient genetic variation. The NCPA interpretation of the significant pattern within the Danube river basin as reflecting isolation by distance should be taken with caution, because similar patterns can reflect nonequilibrium conditions, such as population growth.

Aplikovali jsme nedávno zveřejněnou metodu fylogeografické analýzy hnízdovaných kládů (NCPA) na variabilitu mitochondriální DNA parmy obecné s cílem otestovat schopnost NCPA detekovat evoluční procesy a historické událostí zjištěné tradiční fylogeografickou studií. Hlavní historické události byly zjištěny pomocí NCPA. Některé procesy detekovány nebyly, což bylo pravděpodobně způsobeno nízkou genetickou variabilitou v určitých oblastech. Výstup NCPA ukazující na izolaci vzdáleností v Dunajské populaci parmy je třeba považovat za provizorní, protože podobný fylogeografický vzor může odrážet nerovnovážné podmínky, jako například populační růst.
Permanent Link: http://hdl.handle.net/11104/0134728